176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0198 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0407  hypothetical protein  57.62 
 
 		 623 aa  731    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3011  hypothetical protein  52.31 
 
 		 628 aa  682    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.548541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1196  hypothetical protein  57.3 
 
 		 623 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26630  hypothetical protein  57.97 
 
 		 620 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1584  hypothetical protein  55.86 
 
 		 623 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468978  normal  0.21502 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0262  hypothetical protein  57.46 
 
 		 623 aa  729    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2451  type VI secretion protein, VC_A0110 family  50.56 
 
 		 624 aa  659    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00678774  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1604  hypothetical protein  57.62 
 
 		 623 aa  731    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1787  hypothetical protein  57.62 
 
 		 623 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.973782  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2956  hypothetical protein  57.14 
 
 		 623 aa  722    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0198  type VI secretion protein, VC_A0110 family  100 
 
 		 623 aa  1256    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2831  hypothetical protein  57.46 
 
 		 623 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.843813  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0457  hypothetical protein  57.62 
 
 		 623 aa  731    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1690  type VI secretion protein, VC_A0110 family  48.65 
 
 		 626 aa  598  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0136  hypothetical protein  46.65 
 
 		 626 aa  586  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.640708  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1480  hypothetical protein  49.68 
 
 		 624 aa  585  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1621  hypothetical protein  46.49 
 
 		 626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6689  type VI secretion protein  47.45 
 
 		 626 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01070  hypothetical protein  48.48 
 
 		 619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.970936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0172  hypothetical protein  46.49 
 
 		 626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0150  hypothetical protein  46.49 
 
 		 626 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0160  hypothetical protein  48.16 
 
 		 619 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3012  type VI secretion protein  47.44 
 
 		 626 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0093996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2329  hypothetical protein  48.48 
 
 		 619 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250142  normal  0.0432073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3859  type VI secretion protein  46.57 
 
 		 624 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3469  hypothetical protein  46.98 
 
 		 629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136581  normal  0.824361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3903  type VI secretion protein  46.59 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.757751 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0975  hypothetical protein  46.21 
 
 		 629 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0298  type VI secretion protein, family  46.59 
 
 		 627 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.384287 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0306  type VI secretion protein, family  46.43 
 
 		 627 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.665543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0293  type VI secretion protein  46.59 
 
 		 627 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.632064 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0339  hypothetical protein  46.42 
 
 		 629 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0946  type VI secretion protein, VC_A0110 family  46.1 
 
 		 629 aa  548  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2697  hypothetical protein  43.38 
 
 		 626 aa  542  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0572171  normal  0.0131261 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1904  hypothetical protein  46.42 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1700  SciC protein  46.26 
 
 		 629 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1361  hypothetical protein  43.38 
 
 		 626 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1473  type VI secretion protein  43.38 
 
 		 626 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.830941  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0915  hypothetical protein  46.42 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.621358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1202  hypothetical protein  46.42 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0248  hypothetical protein  46.26 
 
 		 629 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2177  hypothetical protein  46.42 
 
 		 629 aa  545  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00261  SciC protein  46.31 
 
 		 625 aa  539  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.527979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0527  type VI secretion protein, VC_A0110 family  45.61 
 
 		 630 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4431  hypothetical protein  44.27 
 
 		 630 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6119  type VI secretion protein  42.68 
 
 		 629 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.129675  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4086  type VI secretion protein  42.09 
 
 		 638 aa  492  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000236966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1280  hypothetical protein  41.14 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3177  type VI secretion protein  41.65 
 
 		 654 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.774519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1828  hypothetical protein  40.66 
 
 		 639 aa  452  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0448  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.56 
 
 		 628 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7023  type VI secretion protein  38.22 
 
 		 633 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0022  type VI secretion protein  39.78 
 
 		 637 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2789  type VI secretion protein, VC_A0110 family  39.4 
 
 		 642 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2271  hypothetical protein  35.77 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3097  hypothetical protein  35.55 
 
 		 606 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2625  hypothetical protein  35.64 
 
 		 606 aa  346  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4956  hypothetical protein  34.38 
 
 		 610 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2767  type VI secretion protein  35.32 
 
 		 606 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399932  normal  0.648894 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2507  type VI secretion protein  34.07 
 
 		 606 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0116993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3038  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.39 
 
 		 647 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2364  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.23 
 
 		 652 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0952212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3039  type VI secretion protein, VC_A0110 family  36.15 
 
 		 590 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2596  hypothetical protein  33.91 
 
 		 641 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000554833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1211  type VI secretion protein, VC_A0110 family  35.51 
 
 		 590 aa  325  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3076  hypothetical protein  34.82 
 
 		 605 aa  317  4e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3631  hypothetical protein  35.25 
 
 		 612 aa  309  8e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3640  hypothetical protein  35.25 
 
 		 612 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3656  hypothetical protein  35.25 
 
 		 612 aa  309  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2364  hypothetical protein  30 
 
 		 609 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.843191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0406  type VI secretion protein  34.62 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.65912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0056  hypothetical protein  35.09 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1711  hypothetical protein  35.09 
 
 		 612 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3563  hypothetical protein  34.29 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2960  hypothetical protein  35.09 
 
 		 612 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0385  hypothetical protein  34.46 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2635  hypothetical protein  33.97 
 
 		 611 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.881877  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0471  hypothetical protein  33.97 
 
 		 611 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0449  type VI secretion protein  33.97 
 
 		 611 aa  303  8.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.869573 
 
 
-
 
NC_003296  RS01961  hypothetical protein  34.54 
 
 		 616 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0957236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34010  hypothetical protein  35.75 
 
 		 597 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110029  normal  0.162624 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2926  type VI secretion protein  33.65 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2892  hypothetical protein  35.75 
 
 		 597 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50840  hypothetical protein  36.32 
 
 		 597 aa  299  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.232659  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4917  type VI secretion protein, VC_A0110 family  33.6 
 
 		 612 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.263892  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3410  hypothetical protein  34.52 
 
 		 589 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3125  hypothetical protein  34.43 
 
 		 621 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0554912  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5982  type VI secretion protein  32.47 
 
 		 589 aa  279  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02049  EvpF  33.71 
 
 		 611 aa  278  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0842725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0048  hypothetical protein  32.59 
 
 		 587 aa  276  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3481  hypothetical protein  34.59 
 
 		 621 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.639644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2173  hypothetical protein  30.77 
 
 		 610 aa  266  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0216331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6046  hypothetical protein  32.27 
 
 		 593 aa  263  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.739276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2447  hypothetical protein  32.76 
 
 		 620 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00953014  normal  0.864347 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1729  hypothetical protein  32.69 
 
 		 586 aa  261  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162099  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4077  hypothetical protein  30.91 
 
 		 588 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0270196  unclonable  0.00000124343 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1534  hypothetical protein  30.27 
 
 		 611 aa  253  7e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2621  hypothetical protein  30.48 
 
 		 588 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.264727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3227  type VI secretion protein  30 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2124  hypothetical protein  30.32 
 
 		 588 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.369008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>