41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0196 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0196  virulence protein SciE type  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01040  putative secretion protein  37.83 
 
 		 281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1478  virulence protein, SciE type  36.68 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0158  virulence protein, SciE type  37.02 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2327  virulence protein, SciE type  36.64 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0365801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0525  virulence protein SciE type  34.21 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3856  virulence protein SciE type  34.43 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3009  virulence protein SciE type  34.98 
 
 		 271 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1931  hypothetical protein  31.52 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.350891  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1377  ImpE family protein  31.52 
 
 		 268 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1489  virulence protein SciE type  31.52 
 
 		 268 aa  132  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747548  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1686  virulence protein SciE type  32.58 
 
 		 275 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.207214  normal  0.113631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00263  ImpE protein  35.42 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0293  SciE protein  30.14 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.816472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0295  SciE protein  30.14 
 
 		 274 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.227917 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0300  SciE protein  29.79 
 
 		 274 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.721979  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0308  hypothetical protein  29.79 
 
 		 274 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.914397 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3010  virulence protein SciE type  32.31 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2453  virulence protein SciE type  31.77 
 
 		 275 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0611141  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6117  virulence protein SciE type  30.91 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  0.445465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0977  virulence protein, SciE type  30.4 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3471  virulence protein, SciE type  32.84 
 
 		 283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0944  virulence protein SciE type  30.69 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6691  virulence protein SciE type  31.77 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0138  ImpE protein superfamily protein  29.34 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.519374  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0152  ImpE/SciE family protein  29.07 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0174  ImpE/SciE family protein  29.07 
 
 		 268 aa  106  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1623  SciE protein  28.96 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000023  protein of avirulence locus ImpE  26.88 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.692484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0337  ImpE/SciE family protein  27.92 
 
 		 321 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0246  ImpE/SciE family protein  28.37 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.959289  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1698  ImpE protein superfamily protein  28.37 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3074  virulence protein, SciE type  28.92 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2179  ImpE/SciE family protein  27.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1204  hypothetical protein  27.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0917  hypothetical protein  27.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.79149  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1906  hypothetical protein  27.92 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2366  virulence protein, SciE type  20.94 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1532  hypothetical protein  27.2 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3028  virulence protein, SciE type  31.28 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0281455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6048  hypothetical protein  26.06 
 
 		 275 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>