123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0195 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0195  protein of unknown function DUF796  100 
 
 		 160 aa  328  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1465  hypothetical protein  66.25 
 
 		 160 aa  239  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3005  hypothetical protein  68.75 
 
 		 160 aa  230  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0260  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  217  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3837  hypothetical protein  64.38 
 
 		 160 aa  216  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0274684  normal  0.040602 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0405  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961093  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1198  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1602  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1785  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2958  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2833  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0601722  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0455  hypothetical protein  63.58 
 
 		 163 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1586  hypothetical protein  61.73 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0453642  normal  0.164589 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2459  protein of unknown function DUF796  65.62 
 
 		 160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.683109  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3019  hypothetical protein  57.86 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26650  hypothetical protein  42.24 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.410921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0938  protein of unknown function DUF796  40 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0136  SciM protein  36.88 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1607  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0819391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0159  SciM protein  36.88 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2091  putative cytoplasmic protein  39.38 
 
 		 160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0123  hypothetical protein  36.25 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6675  hypothetical protein  38.75 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.499457  normal  0.705135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3026  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0317  hemolysin-coregulated protein  33.95 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0305  hemolysin-coregulated protein  33.95 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0351717  normal  0.0452208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0311  hemolysin-coregulated protein  33.95 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0314  hemolysin-coregulated protein  35.19 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0308  hemolysin-coregulated protein  35.19 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0302  hemolysin-coregulated protein  35.19 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0388692  normal  0.0548881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0300  hemolysin-coregulated protein  34.38 
 
 		 161 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.550474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1681  type VI secretion system effector, Hcp1 family  39.13 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2362  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.62 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3476  hypothetical protein  39.39 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.98653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6112  Hcp1 family type VI secretion system effector  39.13 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24668 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3909  Hcp1 family type VI secretion system effector  39.88 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61987 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0982  hypothetical protein  39.26 
 
 		 161 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1911  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0924  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1211  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0331  SciM protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0240  SciM protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.939428  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2186  hypothetical protein  38.79 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3031  type VI secretion system effector, Hcp1 family  35.67 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350836  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1693  hypothetical protein  38.18 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.792973  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0548  protein of unknown function DUF796  34.59 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2324  hypothetical protein  41.51 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233734  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4089  hypothetical protein  36.08 
 
 		 161 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000825402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01030  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0157  hypothetical protein  40.74 
 
 		 162 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5375  protein of unknown function DUF796  35.67 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330014  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3041  type VI secretion system effector, Hcp1 family  29.88 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1209  type VI secretion system effector, Hcp1 family  31.1 
 
 		 165 aa  95.5  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3958  hypothetical protein  31.61 
 
 		 155 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161152  normal  0.0988998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0101  hypothetical protein  33.58 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1935  hypothetical protein  32.89 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1237  hypothetical protein  33.76 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.663187  normal  0.419753 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2258  hypothetical protein  30.92 
 
 		 176 aa  90.9  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0708616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3341  hypothetical protein  34.59 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.183081 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0665  hypothetical protein  34.42 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2498  Hcp1 family type VI secretion system effector  31.36 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.575217  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2776  Hcp1 family type VI secretion system effector  30.77 
 
 		 172 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496256  normal  0.273091 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1369  hypothetical protein  34.36 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2873  hypothetical protein  34.36 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1481  Hcp1 family type VI secretion system effector  34.36 
 
 		 189 aa  84.3  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.82098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3089  hypothetical protein  30.18 
 
 		 180 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0192  Hcp1 family type VI secretion system effector  29.29 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2634  hypothetical protein  30.18 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02047  Hcp family protein  31.21 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0197  hypothetical protein  27.78 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0397493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1633  hypothetical protein  34.51 
 
 		 129 aa  72  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0155782  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4661  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.71 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.222598  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4039  hypothetical protein  28.57 
 
 		 162 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.999117  normal  0.702683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3563  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4886  hypothetical protein  25.31 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.793717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3434  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.471833  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0761  hypothetical protein  29.09 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.29099  normal  0.0623564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0772  Hcp1 family type VI secretion system effector  25.71 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0770  Hcp1 family type VI secretion system effector  24.29 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4965  hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.537882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2445  hypothetical protein  27.16 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5238  hypothetical protein  25.78 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1899  hypothetical protein  28.14 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3123  hypothetical protein  24.54 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.006821  normal  0.0439497 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00264  hypothetical protein  26.95 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2076  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3479  hypothetical protein  23.93 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0327685  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0791  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0702  hypothetical protein  27.54 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0440  hypothetical protein  26.95 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0747  hypothetical protein  26.95 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1042  hypothetical protein  26.95 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2016  hypothetical protein  26.95 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01963  hypothetical protein  22.5 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.229622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4915  type VI secretion system effector, Hcp1 family  26.25 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00101993  hitchhiker  0.00306602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3561  hypothetical protein  26.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00586235  normal  0.966398 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2637  hypothetical protein  26.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0034666  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0383  hypothetical protein  26.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.211293  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0469  hypothetical protein  26.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000529011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0447  Hcp1 family type VI secretion system effector  26.17 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0406517  normal  0.642596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>