More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0173 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 325 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  64.69 
 
 		 322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  62.14 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  58.33 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  60.47 
 
 		 332 aa  362  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  56.6 
 
 		 346 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  57 
 
 		 313 aa  351  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  59.21 
 
 		 317 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  62.42 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  58.22 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  58.22 
 
 		 314 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  50.83 
 
 		 332 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  56.72 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  60.6 
 
 		 330 aa  311  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  50.81 
 
 		 346 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  56.39 
 
 		 310 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  50.17 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  48.01 
 
 		 335 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  48.33 
 
 		 335 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  45.64 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  48.15 
 
 		 314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  42.71 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  43.77 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  41.85 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  43.82 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  38.98 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  34.54 
 
 		 318 aa  187  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  34.34 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  28.18 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  33.33 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 308 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 		 448 aa  109  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 		 229 aa  106  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 221 aa  106  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  35 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  31.86 
 
 		 410 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 226 aa  96.7  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 285 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.96 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 		 284 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 295 aa  95.1  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3901  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 414 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 283 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  26.46 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  31.39 
 
 		 276 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.8 
 
 		 410 aa  92.4  8e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 394 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.41 
 
 		 410 aa  90.1  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 378 aa  89.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 305 aa  89.4  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 		 266 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3212  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 311 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 238 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 287 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 		 298 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 230 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 		 314 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 393 aa  86.3  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  29.78 
 
 		 285 aa  86.3  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 259 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  23.86 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 527 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 531 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3852  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 231 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 430 aa  82.4  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  22.77 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  27.67 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  28.18 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>