285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0096 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0096  MaoC domain protein dehydratase  100 
 
 
147 aa  299  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0225  MaoC-like dehydratase  71.23 
 
 
151 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369748  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3664  dehydratase  67.83 
 
 
151 aa  205  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2195  MaoC domain protein dehydratase  45.32 
 
 
161 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.300893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1872  MaoC domain protein dehydratase  45.32 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1080  MoaC domain-containing protein  42.76 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1455  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1309  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1318  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1810  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0727  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0718  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0432  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2320  MaoC domain protein dehydratase  45.8 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1149  MoaC domain-containing protein  41.38 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.58838  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2043  hypothetical protein  44.6 
 
 
156 aa  128  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.770796  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4342  MaoC domain protein dehydratase  47.52 
 
 
180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.482582 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0980  MaoC-like dehydratase  43.97 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.740062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1364  MaoC domain protein dehydratase  41.96 
 
 
152 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362364  hitchhiker  0.00124246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3190  putative (R)-specific enoyl-CoA hydratase, MaoC- like  41.96 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2396  dehydratase  44.6 
 
 
334 aa  124  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0902471  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3698  MaoC-related protein  44.2 
 
 
155 aa  123  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.27276  normal  0.530433 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0946  MaoC-like dehydratase  42.96 
 
 
149 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1990  dehydratase  40.56 
 
 
152 aa  122  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  normal  0.551066 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0349  MaoC domain protein dehydratase  43.51 
 
 
152 aa  120  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2125  MaoC-like dehydratase  40.85 
 
 
152 aa  120  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.133316  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2815  MaoC domain protein dehydratase  46.77 
 
 
334 aa  120  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1191  MaoC-like dehydratase  44.93 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2254  dehydratase  41.86 
 
 
158 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.437437  normal  0.402982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1835  MaoC domain protein dehydratase  45.53 
 
 
133 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0897261  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1628  dehydratase  41.79 
 
 
161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.584563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3997  MaoC-like dehydratase  41.48 
 
 
155 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1390  dehydratase  42.86 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1771  hypothetical protein  43.31 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4157  MaoC-like dehydratase  40.74 
 
 
156 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.967717  normal  0.32934 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1487  maoC-related protein  41.79 
 
 
166 aa  113  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1538  maoC-related protein  41.04 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0790227  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5558  MaoC-like dehydratase  39.16 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1618  MaoC-like dehydratase  39.16 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0047  MaoC domain protein dehydratase  41.41 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2254  dehydratase  39.16 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2230  dehydratase  39.16 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2486  dehydratase  43.26 
 
 
352 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494173  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2773  MaoC domain protein dehydratase  39.16 
 
 
154 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377896  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1047  dehydratase  38.46 
 
 
153 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0118845  normal  0.124515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2414  MaoC domain protein dehydratase  43.26 
 
 
332 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2268  dehydratase  38.46 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2147  dehydratase  37.76 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159813  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4836  MaoC domain protein dehydratase  40.6 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2796  MaoC domain protein dehydratase  45.71 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2709  MaoC domain protein dehydratase  41.84 
 
 
332 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.677067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2160  MaoC-like dehydratase  40.28 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2601  dehydratase  41.8 
 
 
154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.801484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3099  MaoC-like dehydratase  41.79 
 
 
153 aa  106  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2508  MaoC-like dehydratase  38.1 
 
 
153 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.184666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0169  dehydratase  44.44 
 
 
334 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0997526  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2268  dehydratase  37.32 
 
 
151 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.276096  normal  0.630961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3196  hypothetical protein  38.73 
 
 
156 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0047  dehydratase  40.16 
 
 
157 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1473  dehydratase  39.57 
 
 
172 aa  104  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3037  MaoC domain protein dehydratase  37.93 
 
 
163 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667967  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4123  dehydratase  40.88 
 
 
329 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4164  MaoC domain protein dehydratase  41.94 
 
 
160 aa  103  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1419  MaoC-like dehydratase  40.85 
 
 
151 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.982529  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3961  MaoC domain protein dehydratase  43.1 
 
 
120 aa  100  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3454  MaoC domain protein dehydratase  38.71 
 
 
158 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0028  dehydratase  33.8 
 
 
142 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2522  MaoC domain-containing protein  33.8 
 
 
142 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0109076  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0028  dehydratase  33.8 
 
 
142 aa  99  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.280729  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5482  dehydratase  42.4 
 
 
147 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0849  MaoC-like dehydratase  42.74 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05499  hypothetical protein  40.16 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.755467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0800  MaoC domain-containing protein dehydratase  41.88 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2253  dehydratase  39.86 
 
 
160 aa  96.7  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350029  normal  0.321633 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1662  dehydratase  42.06 
 
 
146 aa  94.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1772  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1539  maoC-related protein  35.71 
 
 
160 aa  92  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250749  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1420  MaoC-like dehydratase  37.06 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.788165  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1627  dehydratase  34.42 
 
 
160 aa  90.5  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3209  MaoC domain protein dehydratase  39.69 
 
 
152 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0647415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0620  MaoC-like dehydratase  39.52 
 
 
157 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3543  MaoC-like dehydratase  35.04 
 
 
154 aa  89  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.925592  normal  0.245974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2194  MaoC-like dehydratase  39.06 
 
 
159 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3996  MaoC-like dehydratase  40.26 
 
 
160 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2976  dehydratase  37.41 
 
 
158 aa  87.8  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.164001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4835  MaoC domain protein dehydratase  35.53 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3098  MaoC-like dehydratase  38.46 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4156  MaoC-like dehydratase  37.5 
 
 
160 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.717491  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4680  dehydratase  33.8 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1809  dehydratase  34.65 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0834383  normal  0.792889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2600  dehydratase  35.04 
 
 
158 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3813  MaoC domain protein dehydratase  38.6 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18160  hypothetical protein  37.1 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2774  MaoC domain protein dehydratase  35.2 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2249  dehydratase  37.3 
 
 
171 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  normal  0.226342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2490  MaoC domain protein dehydratase  33.81 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2161  MaoC-like dehydratase  34.72 
 
 
154 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4775  MaoC domain protein dehydratase  38.97 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2604  dehydratase  40.62 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.836976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3038  MaoC domain protein dehydratase  37.07 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.724485  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2507  MaoC-like dehydratase  33.8 
 
 
161 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.183824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>