226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0074 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0074  protein of unknown function DUF849  100 
 
 		 308 aa  638    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  69.64 
 
 		 305 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0368988 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4921  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  66.67 
 
 		 296 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197144  normal  0.584863 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6459  protein of unknown function DUF849  59.04 
 
 		 299 aa  351  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0209  hypothetical protein  45.21 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0190  hypothetical protein  36.43 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.881715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2990  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  37.29 
 
 		 305 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1078  hypothetical protein  37.29 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2137  hypothetical protein  36.77 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000999013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3885  hypothetical protein  36.18 
 
 		 273 aa  162  6e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4391  protein of unknown function DUF849  34.97 
 
 		 321 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1884  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.05 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0818534 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6226  hypothetical protein  38.87 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00955667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1340  protein of unknown function DUF849  38.41 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16260  hypothetical protein  38.38 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2380  protein of unknown function DUF849  35.52 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.625502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2345  hypothetical protein  35.27 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.117765  normal  0.494816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1903  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  36.08 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2907  hypothetical protein  35.03 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2173  hypothetical protein  34.5 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414156  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1372  protein of unknown function DUF849  34.14 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2468  protein of unknown function DUF849  35.17 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2423  hypothetical protein  34.71 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2361  hypothetical protein  34.56 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.479394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2346  protein of unknown function DUF849  35.49 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.457877  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1487  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  35.17 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4492  protein of unknown function DUF849  34.11 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5071  hypothetical protein  35.53 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.674247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11733  hypothetical protein  34.71 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0612  hypothetical protein  36.81 
 
 		 309 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3316  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0677839  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5051  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.5247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0344  protein of unknown function DUF849  33 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5233  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2917  hypothetical protein  37.38 
 
 		 295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.041062  normal  0.0930195 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0491  hypothetical protein  36.04 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1958  hypothetical protein  36.04 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0690  hypothetical protein  36.04 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0986  hypothetical protein  36.04 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2128  hypothetical protein  35.71 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3176  hypothetical protein  37.17 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  hitchhiker  0.00732826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0851  hypothetical protein  35.71 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5231  hypothetical protein  37.42 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.225304  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0771  hypothetical protein  33.99 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1068  hypothetical protein  31.16 
 
 		 273 aa  138  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.567235 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3174  hypothetical protein  34.23 
 
 		 293 aa  139  8.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6431  protein of unknown function DUF849  33.11 
 
 		 300 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3589  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.72078  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4741  hypothetical protein  33.77 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0323  hypothetical protein  35.97 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.198912 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0761  hypothetical protein  35.39 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0359  hypothetical protein  33.45 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.639489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0303  hypothetical protein  36.84 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075505 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4459  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0689248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3285  hypothetical protein  35.18 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4979  hypothetical protein  36.16 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0128  protein of unknown function DUF849  33.99 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3968  hypothetical protein  35.69 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4509  protein of unknown function DUF849  35.18 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0327  hypothetical protein  36.18 
 
 		 294 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1848  hypothetical protein  35.64 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2922  hypothetical protein  33.55 
 
 		 301 aa  135  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.565171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0229  protein of unknown function DUF849  35.76 
 
 		 293 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.747002  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0827  hypothetical protein  34.94 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4905  hypothetical protein  35.31 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0922631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0635  hypothetical protein  33.56 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1780  hypothetical protein  35.57 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0176081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3825  hypothetical protein  32.12 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1937  hypothetical protein  34.78 
 
 		 295 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.642383  normal  0.0127736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  32.31 
 
 		 453 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3295  hypothetical protein  33.44 
 
 		 305 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0500  hypothetical protein  34.73 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2002  hypothetical protein  31.23 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1017  protein of unknown function DUF849  32.55 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000125138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2188  hypothetical protein  33.66 
 
 		 305 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5853  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  33 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.493531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71150  hypothetical protein  33.23 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.185944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6173  hypothetical protein  33.23 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1538  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.724625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  29.79 
 
 		 449 aa  115  6e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2623  protein of unknown function DUF849  29.83 
 
 		 287 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2297  hypothetical protein  30.55 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.843148  normal  0.307686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1594  protein of unknown function DUF849  32.04 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1080  hypothetical protein  27.61 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.431343  normal  0.325295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1910  hypothetical protein  31.79 
 
 		 311 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.476578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3741  hypothetical protein  29.3 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3969  hypothetical protein  30.91 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3015  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  28.98 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0103  hypothetical protein  30.24 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.109916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4531  hypothetical protein  27.86 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2322  hypothetical protein  29.62 
 
 		 310 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000925474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0314  hypothetical protein  30.33 
 
 		 280 aa  109  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0977  protein of unknown function DUF849  30.28 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2085  protein of unknown function DUF849  28.39 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.359333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1687  hypothetical protein  29.28 
 
 		 309 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382631  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4226  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.43 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5036  3-keto-5-aminohexanoate cleavage enzyme  29.55 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0377  hypothetical protein  30.07 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3415  hypothetical protein  30.89 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>