71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0064 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  61.72 
 
 		 294 aa  355  5e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  39.02 
 
 		 320 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  38.68 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  38.21 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  34.77 
 
 		 295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  35.87 
 
 		 308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  40.19 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  36.84 
 
 		 343 aa  105  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  35.32 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  29.67 
 
 		 287 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  35.75 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  32.53 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  41.5 
 
 		 323 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  34.62 
 
 		 279 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  34.84 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  36.06 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  35.1 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  36.92 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  35.16 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  24.72 
 
 		 288 aa  89  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  37.02 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  27.18 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  34.39 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.77 
 
 		 285 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  37.44 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  30.95 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  30.33 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  30.53 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  25.23 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.14 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  32.14 
 
 		 326 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  26.73 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  31.28 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  31.43 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  28.37 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  22.6 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  26.01 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  21.19 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  28.63 
 
 		 326 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  29.23 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1203  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  30.06 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  22.31 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  32.76 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  25.46 
 
 		 322 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  32.76 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1832  magnesium chelatase accessory protein  30.24 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1433  alpha/beta hydrolase fold  20 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2045  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  31.73 
 
 		 286 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  26.81 
 
 		 364 aa  46.6  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  28.17 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1479  alpha/beta hydrolase fold protein  20.78 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  41.67 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0617  peptidase S15  25.79 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000016795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.25 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1329  hypothetical protein  29.81 
 
 		 223 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.44 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2283  alpha/beta hydrolase fold protein  41.79 
 
 		 265 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  27.37 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4919  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.582438  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>