47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0056 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0056  adenylate cyclase  100 
 
 		 172 aa  347  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1526  adenylate cyclase  68.64 
 
 		 176 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0568  adenylate cyclase  64.91 
 
 		 179 aa  222  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0631  adenylate cyclase  62.57 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.446364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1262  adenylate cyclase  56.73 
 
 		 172 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102777  normal  0.401901 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0323  adenylyl cyclase CyaB  54.76 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.362109  normal  0.0195848 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1326  adenylate cyclase  55.56 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0444909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1389  hypothetical protein  53.22 
 
 		 172 aa  167  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0071  adenylate cyclase  51.16 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0079  adenylate cyclase  51.16 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3335  adenylate cyclase  51.16 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2975  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0080  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0098  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 177 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0080  adenylate cyclase  50.87 
 
 		 177 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.678459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0013  putative adenylate cyclase  50.58 
 
 		 178 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3381  putative adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1614  putative adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0204  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3999  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4073  adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2988  putative adenylate cyclase  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2929  adenylate cyclase, putative  50.58 
 
 		 176 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3919  adenylate cyclase  50 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.682505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3261  adenylate cyclase  49.42 
 
 		 177 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3053  adenylate cyclase  50.29 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3048  adenylate cyclase  38.51 
 
 		 179 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.128686  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1059  adenylate cyclase  35.06 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.743648  normal  0.0414409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0548  adenylate cyclase  36.36 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3778  adenylate cyclase CyaB, putative  35 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0038  putative adenylyl cyclase CyaB  27.96 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.318646  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1114  putative adenylyl cyclase CyaB  43.66 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.643274 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1326  putative adenylyl cyclase CyaB  35.06 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.422285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0075  putative adenylyl cyclase CyaB  35.06 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.109831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0940  putative adenylyl cyclase CyaB  33.33 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0901  adenylyl cyclase CyaB  29.13 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0875  putative adenylyl cyclase CyaB  28.16 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0067  adenylyl cyclase CyaB  40.74 
 
 		 176 aa  42  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.160565  normal  0.206262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1350  adenylate cyclase 2  28.21 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0174263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2804  adenylate cyclase, class IV  28.21 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3461  putative adenylyl cyclase CyaB  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0910  putative adenylyl cyclase CyaB  30 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0024  adenylate cyclase  25.68 
 
 		 183 aa  41.2  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1935  adenylate cyclase  29.27 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00466325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1050  putative adenylate cyclase CyaB  29.87 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1665  putative adenylyl cyclase CyaB  27.66 
 
 		 183 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0037  adenylate cyclase  27.01 
 
 		 176 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>