16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0053 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0053  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  344  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3701  hypothetical protein  69.94 
 
 		 168 aa  244  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.402351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5817  hypothetical protein  62.96 
 
 		 166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0739002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0810  hypothetical protein  61.82 
 
 		 166 aa  215  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2510  hypothetical protein  61.73 
 
 		 166 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1874  hypothetical protein  61.73 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2485  hypothetical protein  61.73 
 
 		 166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.247723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5150  hypothetical protein  30.82 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953458  normal  0.848827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2528  hypothetical protein  33.77 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.566814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0525  hypothetical protein  31.97 
 
 		 268 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0129049  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4719  hypothetical protein  24.55 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5049  hypothetical protein  29.63 
 
 		 268 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3255  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5113  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6824  hypothetical protein  29.25 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5168  hypothetical protein  27.1 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0535047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>