75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0035 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0035  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  587  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0952  hypothetical protein  37.26 
 
 		 291 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.600635  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  37.4 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5564  hypothetical protein  36 
 
 		 296 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0130  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 313 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5263  hypothetical protein  38.8 
 
 		 303 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1188  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51206 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1037  alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4327  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.259256  normal  0.0593909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0346  carboxylesterase  26.85 
 
 		 265 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154149  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0032  carboxylesterase  26.25 
 
 		 274 aa  117  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.436632  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2291  hydrolase alpha/beta fold domain-containing protein  31.23 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0969  thermostable monoacylglycerol lipase  31.23 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1054  esterase/lipase  31.23 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0843  hypothetical protein  32.42 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4387  esterase/lipase-like protein  30.83 
 
 		 271 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5791  esterase/lipase-like protein  30.83 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5069  esterase/lipase-like  30.83 
 
 		 271 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.337118  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0912  hypothetical protein  32.03 
 
 		 274 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0604  esterase/lipase-like protein  31.37 
 
 		 407 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163166  normal  0.45862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3077  esterase/lipase-like  29.64 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4661  Alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5529  carboxylesterase  28.52 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2633  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  24.8 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5127  alpha/beta hydrolase fold  23.41 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24830  esterase/lipase  25.66 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.421093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1551  putative esterase/lipase  25.78 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.152669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3105  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0635693  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1828  acylglycerol lipase  26.79 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2086  lysophospholipase L2, putative  25.3 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6060  esterase/lipase  22.31 
 
 		 265 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0218  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4937  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 		 258 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451506  normal  0.754378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3089  putative esterase/lipase  26.4 
 
 		 265 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2705  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.146547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1550  putative esterase/lipase  24.53 
 
 		 270 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00836288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3541  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3609  alpha/beta hydrolase fold protein  26.38 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1312  alpha/beta hydrolase  24.8 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364828  normal  0.304741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1086  alpha/beta hydrolase fold protein  24.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3458  Alpha/beta hydrolase fold-1  26.38 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894454  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0278  putative esterase/lipase  23.86 
 
 		 252 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000266286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1112  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.48 
 
 		 736 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0820  carboxyesterase precursor-like protein  20.23 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0804  esterase/lipase-like protein  20.23 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00548514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3567  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  hitchhiker  0.00484943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3149  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.98 
 
 		 736 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.530359  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13780  esterase/lipase  29.3 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0795828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0119  carboxylesterase, putative  17.13 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16110  esterase/lipase  26.88 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0607403  normal  0.622772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4922  carboxylesterase  21.18 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00817956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2516  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 634 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300353 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2855  Esterase/lipase-like protein  22.22 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0941  phospholipase/carboxylesterase  29.41 
 
 		 552 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.443784 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2449  alpha/beta hydrolase fold  22.05 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595551  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3674  carboxylesterase  21.01 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000231487  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2355  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0504703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4809  carboxylesterase  21.88 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1939  lysophospholipase L2, putative  27.43 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1708  putative carboxylesterase  24.21 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0775899 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2956  carboxylesterase  20.7 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000116225  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3126  carboxylesterase  21.09 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2473  alpha/beta hydrolase fold  20.08 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0084305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2227  alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 248 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5233  carboxylesterase  21.48 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0438362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5279  carboxylesterase  21.48 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258033  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1551  putative esterase/lipase  34.67 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.38652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5215  carboxylesterase  21.48 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5708  carboxylesterase  21.48 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00884556  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4819  carboxylesterase  21.48 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000134966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5244  carboxylesterase  21.48 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.239449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>