More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0031 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  58.84 
 
 		 799 aa  735    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  60.7 
 
 		 748 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  48.51 
 
 		 791 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  60.05 
 
 		 740 aa  783    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  57.53 
 
 		 732 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  56.45 
 
 		 1061 aa  715    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2466  heavy metal translocating P-type ATPase  57.85 
 
 		 745 aa  653    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.392778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  58.97 
 
 		 799 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  57.92 
 
 		 732 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  57.91 
 
 		 937 aa  710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0019  heavy metal translocating P-type ATPase  67.14 
 
 		 782 aa  911    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  55.97 
 
 		 872 aa  727    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  61.88 
 
 		 819 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  60.86 
 
 		 790 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  56.71 
 
 		 1061 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  58.57 
 
 		 797 aa  739    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  58.76 
 
 		 792 aa  761    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  56.45 
 
 		 1061 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  58.42 
 
 		 1040 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  51.25 
 
 		 758 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  56.73 
 
 		 971 aa  690    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  59.43 
 
 		 817 aa  763    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  68.09 
 
 		 757 aa  897    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0821  heavy metal translocating P-type ATPase  57.34 
 
 		 790 aa  717    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  59.79 
 
 		 813 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  55.89 
 
 		 730 aa  707    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  55.89 
 
 		 730 aa  707    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  60.05 
 
 		 816 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  56.44 
 
 		 795 aa  713    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  49.4 
 
 		 793 aa  673    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  60.46 
 
 		 739 aa  712    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  59.1 
 
 		 1182 aa  736    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  58.2 
 
 		 799 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  60.27 
 
 		 813 aa  724    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  63.12 
 
 		 754 aa  770    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  56.45 
 
 		 1061 aa  715    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  58.45 
 
 		 1021 aa  735    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  58.3 
 
 		 800 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  57.85 
 
 		 835 aa  733    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0037  heavy metal translocating P-type ATPase  67.27 
 
 		 782 aa  913    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.374671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  59.97 
 
 		 741 aa  777    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  57.67 
 
 		 1013 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  58.19 
 
 		 946 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  58.76 
 
 		 792 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  58.45 
 
 		 1021 aa  735    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  56.45 
 
 		 1063 aa  715    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0031  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 747 aa  1446    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  69.01 
 
 		 767 aa  880    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  60.43 
 
 		 804 aa  763    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  49.39 
 
 		 789 aa  636    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  56.45 
 
 		 1063 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  45.81 
 
 		 743 aa  635  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  48.17 
 
 		 724 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  48.19 
 
 		 803 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1894  heavy metal translocating P-type ATPase  53.74 
 
 		 754 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 815 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.99 
 
 		 794 aa  597  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  51.8 
 
 		 823 aa  597  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.4 
 
 		 797 aa  595  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  46.28 
 
 		 753 aa  592  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  44.92 
 
 		 752 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  43.83 
 
 		 805 aa  579  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  42.4 
 
 		 802 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  42.4 
 
 		 802 aa  581  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  43.23 
 
 		 798 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 750 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  42.1 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  44.4 
 
 		 821 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  42.1 
 
 		 759 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  47.23 
 
 		 794 aa  568  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  43.09 
 
 		 817 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  43.7 
 
 		 805 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  43.7 
 
 		 805 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 797 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  48.11 
 
 		 793 aa  562  1.0000000000000001e-159  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  45.61 
 
 		 799 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  43.83 
 
 		 805 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  43.76 
 
 		 806 aa  559  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.57 
 
 		 818 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  43.88 
 
 		 786 aa  561  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  43.43 
 
 		 805 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  43.7 
 
 		 805 aa  558  1e-157  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  43.43 
 
 		 805 aa  558  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 		 806 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  47.16 
 
 		 837 aa  558  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 		 836 aa  558  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  43.76 
 
 		 806 aa  557  1e-157  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 		 826 aa  553  1e-156  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  47.57 
 
 		 801 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  43.52 
 
 		 754 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  45.51 
 
 		 814 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 837 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  42.35 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  45.27 
 
 		 835 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  45.19 
 
 		 868 aa  544  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  41.37 
 
 		 796 aa  542  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  42.72 
 
 		 885 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1570  heavy metal translocating P-type ATPase  45.06 
 
 		 747 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.706467  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  45.59 
 
 		 836 aa  541  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>