9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0025 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0025  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1227  hypothetical protein  69 
 
 		 230 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.423523  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3365  hypothetical protein  63.5 
 
 		 234 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3620  hypothetical protein  62 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0813  hypothetical protein  62.5 
 
 		 203 aa  261  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0884  hypothetical protein  62.5 
 
 		 203 aa  261  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3472  hypothetical protein  64.68 
 
 		 201 aa  259  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1483  hypothetical protein  60.11 
 
 		 202 aa  247  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1146  hypothetical protein  55.97 
 
 		 161 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>