120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0022 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  51.02 
 
 		 812 aa  647    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  72.71 
 
 		 701 aa  969    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  62.43 
 
 		 711 aa  794    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  100 
 
 		 691 aa  1402    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  46.94 
 
 		 671 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  32.68 
 
 		 819 aa  309  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  34.38 
 
 		 1362 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.55 
 
 		 751 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.24 
 
 		 723 aa  263  8e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.55 
 
 		 755 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.67 
 
 		 791 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.25 
 
 		 755 aa  259  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  30.62 
 
 		 757 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.46 
 
 		 759 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.14 
 
 		 794 aa  253  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  32.44 
 
 		 732 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  31.21 
 
 		 761 aa  253  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.79 
 
 		 770 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  30.34 
 
 		 750 aa  250  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  33.5 
 
 		 738 aa  249  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.41 
 
 		 722 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  30.79 
 
 		 755 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  29.49 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.92 
 
 		 772 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  29.54 
 
 		 771 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  28.05 
 
 		 760 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.95 
 
 		 772 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  29.42 
 
 		 740 aa  237  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  29.38 
 
 		 763 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.11 
 
 		 771 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.83 
 
 		 776 aa  232  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  27.53 
 
 		 789 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  30.69 
 
 		 774 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.46 
 
 		 725 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  33.17 
 
 		 729 aa  218  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  28.12 
 
 		 712 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  26.6 
 
 		 701 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  27.8 
 
 		 753 aa  207  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  30.05 
 
 		 796 aa  203  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  29.67 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  28.16 
 
 		 831 aa  197  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  25.69 
 
 		 776 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.09 
 
 		 786 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  28.07 
 
 		 1033 aa  168  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  25.47 
 
 		 680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  26.62 
 
 		 833 aa  134  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  25.08 
 
 		 713 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 		 775 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  27.12 
 
 		 840 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  26.81 
 
 		 1109 aa  124  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  26.04 
 
 		 338 aa  95.1  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  26.44 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.62 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 418 aa  70.1  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  26.98 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  28.09 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0477  von Willebrand factor, type A  30.67 
 
 		 571 aa  64.3  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  31.74 
 
 		 416 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  27.17 
 
 		 412 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 418 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  25.77 
 
 		 412 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2796  von Willebrand factor, type A  27.33 
 
 		 543 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.110662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  27.32 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4001  hypothetical protein  20.52 
 
 		 959 aa  57  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000175491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3424  von Willebrand factor type A  32.73 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.7 
 
 		 425 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  28.74 
 
 		 421 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5407  von Willebrand factor type A  22.75 
 
 		 935 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2700  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 		 566 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.557808  normal  0.158328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  27.32 
 
 		 459 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3551  von Willebrand factor type A  27.06 
 
 		 505 aa  54.7  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.104304  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 		 425 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0183  von Willebrand factor, type A  29.82 
 
 		 563 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.174598  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.03 
 
 		 420 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7212  von Willebrand factor type A domain protein  27.54 
 
 		 490 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548543  normal  0.0992669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  24.75 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 419 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 546 aa  52  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3969  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 480 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1017  von Willebrand factor type A; type II secretion system protein  25.64 
 
 		 643 aa  51.2  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 423 aa  51.2  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  28.8 
 
 		 903 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01616  von Willebrand factor type A domain protein  25.82 
 
 		 350 aa  50.8  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2575  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 		 547 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  28.65 
 
 		 412 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  24.04 
 
 		 942 aa  50.4  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  28.4 
 
 		 561 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4506  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6419  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 706 aa  50.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.803942 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  26.74 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1196  von Willebrand factor type A  25.15 
 
 		 639 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1604  von Willebrand factor type A  24.46 
 
 		 1100 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6113  von Willebrand factor type A  29.14 
 
 		 430 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>