12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0015 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0015  protein of unknown function DUF1520  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0017  hypothetical protein  47.83 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  48.95 
 
 		 184 aa  118  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0011  hypothetical protein  44.62 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00169291  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0024  hypothetical protein  51.75 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0029  hypothetical protein  53.57 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0007  hypothetical protein  38.31 
 
 		 209 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.906518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0025  protein of unknown function DUF1520  38.31 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1386  hypothetical protein  39.67 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000111197  normal  0.104164 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4985  hypothetical protein  31.48 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1776  hypothetical protein  32.29 
 
 		 168 aa  43.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.073575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1246  hypothetical protein  35.38 
 
 		 179 aa  42  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>