More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p320_28 on replicon NC_011314
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011314  VSAL_p320_28  iron ion transport system, inner membrane component  100 
 
 		 347 aa  673    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.260829  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5707  transport system permease protein  43.77 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  41.09 
 
 		 344 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3469  transport system permease protein  45.14 
 
 		 339 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0510  iron compounds ABC transporter, permease protein  41.69 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1482  transport system permease protein  40.72 
 
 		 338 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2846  transport system permease protein  44.38 
 
 		 345 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  38.68 
 
 		 369 aa  249  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1425  transport system permease protein  44.76 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1169  transport system permease protein  46.11 
 
 		 324 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  40.51 
 
 		 347 aa  242  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3529  transport system permease protein  38.62 
 
 		 348 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.914078  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1373  transport system permease protein  44.13 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  38.11 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0497  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  41.4 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.760715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  41.28 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0891  ABC transporter permease  39.56 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1287  response regulator  40.76 
 
 		 336 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.023456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1986  transport system permease protein  40.95 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0028  transport system permease protein  44.07 
 
 		 354 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  37.09 
 
 		 356 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0813  HmuU protein  40 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00319044  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1994  transport system permease protein  41.67 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1473  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2552  transport system permease protein  38.64 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.822821  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  37.65 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1043  hypothetical protein  45.23 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.696998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  36.68 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1283  transport system permease protein  38.99 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1695  transport system permease protein  40.62 
 
 		 349 aa  222  9e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0857998  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2329  transport system permease protein  40 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2222  transport system permease protein  34.94 
 
 		 346 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.205591  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2064  transport system permease protein  43.17 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1656  transport system permease protein  40.65 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636963  normal  0.143618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1202  ABC transporter permease  38.96 
 
 		 326 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.820499  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1538  transport system permease protein  40.57 
 
 		 341 aa  216  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1424  transport system permease protein  42.06 
 
 		 350 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.320274  normal  0.156715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0494  transport system permease protein  40 
 
 		 336 aa  215  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.877978  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  42.6 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  42.6 
 
 		 327 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1533  hexapaptide repeat-containing transferase  36.48 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.804151  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0445  transport system permease protein  39.43 
 
 		 336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2479  transport system permease protein  40.31 
 
 		 340 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.158013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  38.66 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2075  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  39.56 
 
 		 333 aa  209  6e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1676  transport system permease protein  40.62 
 
 		 349 aa  209  7e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0954  transport system permease protein  38.53 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.492896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0447  transport system permease protein  37.26 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.279756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  37.42 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0602  ABC transporter permease  39.24 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3703  transport system permease protein  37.22 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.912274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0154  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  37.77 
 
 		 351 aa  202  5e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  36.73 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1542  transport system permease protein  38.24 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  37.26 
 
 		 349 aa  199  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.53 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  37.66 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  36.73 
 
 		 349 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1462  transport system permease protein  38.61 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.868  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01860  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.74 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0684072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1948  iron(III) ABC transporter, permease protein  38.18 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0628531 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0232  transport system permease protein  36.64 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.691146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26440  iron(III) ABC transporter-permease protein  42.77 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.508803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0248  transport system permease protein  40.84 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3222  transport system permease protein  38.21 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.51 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2735  transport system permease protein  38.22 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0854593  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3031  transport system permease protein  37.62 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4649  transport system permease protein  38.39 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0418  transport system permease protein  42.68 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  35.84 
 
 		 367 aa  186  6e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  32.32 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0865  transport system permease protein  41.7 
 
 		 322 aa  185  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0529  transport system permease protein  37.8 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550834  normal  0.720175 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2366  transport system permease protein  34.46 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  39.56 
 
 		 315 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  34.9 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2005  transport system permease protein  38.58 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0934692  normal  0.372795 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0279  ABC transporter permease  38.01 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.590868  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  35.69 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0845  transport system permease protein  36.36 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1614  ABC transporter permease  33.55 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0868  transport system permease protein  35.64 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  38.05 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.63 
 
 		 361 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  34.29 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  39.36 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  36.75 
 
 		 330 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1514  transport system permease protein  37.13 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  35.83 
 
 		 358 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  37.1 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2393  iron ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  34.7 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  32.95 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  34.1 
 
 		 348 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  33.44 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  40.85 
 
 		 316 aa  172  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  34.04 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  33.81 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>