More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1070 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  100 
 
 		 402 aa  806    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1225  putative multidrug resistance protein  60.88 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2851  major facilitator superfamily protein  58.27 
 
 		 409 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2800  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 399 aa  371  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02138  hypothetical protein  54.21 
 
 		 403 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003683  permease  52.42 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1294  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.556112  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2720  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1423  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 393 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.775397  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1454  major facilitator transporter  35.81 
 
 		 409 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0344021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1721  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.554921  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1955  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1825  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.010235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1390  major facilitator transporter  36.83 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1622  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 436 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1697  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2957  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1672  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 437 aa  193  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000523239  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1692  Xaa-His dipeptidase  34.1 
 
 		 436 aa  193  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1544  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 415 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1917  multidrug resistance protein, putative  32.6 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2913  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2832  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1731  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2814  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.807872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5298  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 413 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3378  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4989  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 441 aa  190  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1441  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3226  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.361793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1035  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  31.33 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3894  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 445 aa  184  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 417 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  30.23 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  32.35 
 
 		 438 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  32.35 
 
 		 438 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2045  major facilitator superfamily MFS_1  35.6 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.588816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1443  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2281  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  29.43 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1898  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 424 aa  173  5.999999999999999e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.164459  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06410  arabinose efflux permease family protein  29.57 
 
 		 405 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2042  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 422 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2343  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1120  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03772  MFS transporter  32.97 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1604  major facilitator family transporter  29.68 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1917  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01565  predicted transporter  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2047  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1803  major facilitator family transporter  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2034  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01555  hypothetical protein  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4750  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2306  major facilitator family transporter  31.03 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.200396 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1670  major facilitator family transporter  30.21 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2561  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000580351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5217  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.877552  normal  0.0536068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0420  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 422 aa  167  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2753  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2555  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0238485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1518  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0691325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4358  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2848  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.649308  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4629  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 499 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.458536  normal  0.277274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5292  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479452 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2135  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1597  inner membrane transport protein YnfM  29.95 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1656  inner membrane transport protein YnfM  29.95 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1853  inner membrane transport protein YnfM  29.95 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5565  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1686  inner membrane transport protein YnfM  29.95 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1588  inner membrane transport protein YnfM  29.95 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.185202 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3403  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 426 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0185  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.899358 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2214  multidrug resistance protein, putative  34.13 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2302  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.44154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0791  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 434 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.039054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22270  arabinose efflux permease family protein  32.98 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00681057  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1149  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 407 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0220  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3414  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0642  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 422 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2933  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2156  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0208  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3269  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 481 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2333  major facilitator family transporter  28.11 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1968  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 438 aa  149  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.878316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0181  major facilitator family transporter  31.02 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0770  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2213  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 428 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.175074  decreased coverage  0.00000120086 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0403  major facilitator family transporter  32.89 
 
 		 537 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0444  major facilitator family transporter  30.08 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.420207  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03550  arabinose efflux permease family protein  30.17 
 
 		 376 aa  147  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>