176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1053 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  401  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  53.65 
 
 
192 aa  224  6e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  53.19 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  47.4 
 
 
192 aa  200  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  43.59 
 
 
196 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
222 aa  158  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  41.58 
 
 
1287 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  38.74 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  38.78 
 
 
208 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  31.77 
 
 
214 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  31.77 
 
 
214 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  34.44 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  31.49 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  31.79 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  28.35 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  27.32 
 
 
364 aa  81.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  35.37 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.94 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.54 
 
 
207 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  32.72 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  30.87 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  30.57 
 
 
199 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.13 
 
 
218 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  30.2 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  30.07 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  29.63 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  28.66 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  29.63 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  27.65 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  26.17 
 
 
202 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  27.7 
 
 
575 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  24.63 
 
 
440 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  25.33 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0687  Methyltransferase type 12  24.43 
 
 
208 aa  57.8  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.557107 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1909  methyltransferase type 11  22.89 
 
 
560 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  24.84 
 
 
551 aa  57.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  25.53 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1627  methyltransferase type 12  27.67 
 
 
230 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  24.65 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  32.04 
 
 
195 aa  52  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  21.57 
 
 
201 aa  49.7  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 
272 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.07 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  30.36 
 
 
423 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  21.01 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.73 
 
 
390 aa  49.7  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  21.01 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  20.92 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.64 
 
 
224 aa  48.9  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  20.92 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  20.92 
 
 
201 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  20.92 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  20.92 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  20.92 
 
 
201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
215 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2456  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
204 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000386414 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2925  methyltransferase type 11  22.97 
 
 
585 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  23.6 
 
 
212 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.44 
 
 
227 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 
208 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.48 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  25.2 
 
 
209 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
226 aa  46.2  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  29.9 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  25.88 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  35.8 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  33.8 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
201 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  19.86 
 
 
196 aa  45.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1780  methyltransferase type 11  23.42 
 
 
198 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0020102  normal  0.965795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  27.43 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  45.65 
 
 
244 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  33.85 
 
 
201 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  22.67 
 
 
214 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.81 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29 
 
 
222 aa  44.7  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  29.21 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  27.63 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.61 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.63 
 
 
226 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  28.47 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  27.63 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>