132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0887 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  100 
 
 		 247 aa  513  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  68.02 
 
 		 251 aa  359  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  67.61 
 
 		 251 aa  357  9e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  66.27 
 
 		 250 aa  348  4e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  59.18 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  48.18 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  47.95 
 
 		 252 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  47.5 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  46.96 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  48.58 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  45.9 
 
 		 254 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  45.9 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  45.9 
 
 		 254 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  45.49 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  46.09 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  48.18 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  47.77 
 
 		 252 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  46.5 
 
 		 245 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  44.08 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  44.86 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  44.86 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  44.86 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  44.86 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  44.44 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  45.49 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  46.09 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  42.39 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  42.39 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  44.94 
 
 		 246 aa  207  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  42.39 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  42.5 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  42.39 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  43.62 
 
 		 245 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  44.08 
 
 		 250 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  41.98 
 
 		 245 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  42.74 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  41.05 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  40.43 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  38.98 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  36.93 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  37.97 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  37.28 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  37.87 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  39.83 
 
 		 238 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  39.83 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  34.73 
 
 		 239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  34.75 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  33.19 
 
 		 243 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  33.91 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  33.9 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  37.38 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  30.7 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  30.5 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  28.15 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  25.2 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  25.24 
 
 		 557 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  23.7 
 
 		 574 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  25.76 
 
 		 576 aa  63.5  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  24.27 
 
 		 586 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  28.84 
 
 		 381 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  26.85 
 
 		 592 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  24.27 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  29.35 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  25.69 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  26.83 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  27.88 
 
 		 578 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  27.32 
 
 		 562 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  25.96 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  26.94 
 
 		 570 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2109  histidinol phosphate phosphatase HisJ family  24.07 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  25.36 
 
 		 584 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  25.98 
 
 		 576 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  25.98 
 
 		 576 aa  53.9  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0277  histidinol phosphate phosphatase, HisJ  27.04 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0760361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  26.57 
 
 		 578 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  25.81 
 
 		 339 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  25.12 
 
 		 583 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  24.88 
 
 		 614 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  27.27 
 
 		 577 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  22.96 
 
 		 246 aa  52  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  29.17 
 
 		 563 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  24.65 
 
 		 642 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  27.54 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  24.65 
 
 		 650 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  26.14 
 
 		 335 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  28.77 
 
 		 571 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  25 
 
 		 574 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  26.73 
 
 		 576 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 589 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  26.26 
 
 		 570 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  23.62 
 
 		 578 aa  48.5  0.00009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>