More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0858 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  100 
 
 		 275 aa  574  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  55.91 
 
 		 268 aa  288  8e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  55.73 
 
 		 268 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  54.33 
 
 		 312 aa  277  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  42.41 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  42.97 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  43.41 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  38.15 
 
 		 291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  38.49 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.26 
 
 		 558 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  41.41 
 
 		 267 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  41.11 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  41.11 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  41.11 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  41.11 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  41.11 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  41.41 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.64 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.68 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  38.98 
 
 		 268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  38.98 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  40.71 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  38.98 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  40.71 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  37.5 
 
 		 269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  40.71 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  40.71 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  38.76 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  35.18 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  37.07 
 
 		 295 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  38.35 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  37.4 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  38.35 
 
 		 274 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  38.76 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  38.76 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  36.23 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  39.15 
 
 		 272 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  35.16 
 
 		 309 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  37.98 
 
 		 251 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  39.15 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  37.98 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  37.6 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  39.15 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 216 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  33.58 
 
 		 309 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  36.58 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  33.82 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  39.53 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0157  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  38.17 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  34.65 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  34.47 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.41 
 
 		 295 aa  132  5e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.02 
 
 		 295 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  31.08 
 
 		 284 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  31.08 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  34.14 
 
 		 306 aa  125  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  31.52 
 
 		 325 aa  119  7.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  32.94 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.83 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  32.36 
 
 		 315 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  32.28 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  32.28 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 320 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0615  biotin biosynthesis protein BioC  28.31 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.53038  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 		 275 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  29.39 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 383 aa  98.2  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 367 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0619  biotin synthesis protein  28.79 
 
 		 297 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 254 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1663  biotin biosynthesis protein  27.99 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0312  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  28.02 
 
 		 333 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 374 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0259  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 267 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  28.79 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.1 
 
 		 269 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2627  biotin synthesis protein, putative  29.28 
 
 		 267 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.37 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3856  methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 264 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.8 
 
 		 236 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0274  methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 319 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  30.23 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.69 
 
 		 235 aa  89  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  44.55 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  28.68 
 
 		 275 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  31.06 
 
 		 235 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  32.7 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>