More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0837 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0837  L-threonine 3-dehydrogenase  100 
 
 		 343 aa  706    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178921  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0353  L-threonine 3-dehydrogenase  89.5 
 
 		 343 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001213  L-threonine 3-dehydrogenase  92.71 
 
 		 343 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05001  L-threonine 3-dehydrogenase  93 
 
 		 360 aa  669    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3710  L-threonine 3-dehydrogenase  85.63 
 
 		 341 aa  620  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0119  L-threonine 3-dehydrogenase  85.34 
 
 		 341 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0121  L-threonine 3-dehydrogenase  84.12 
 
 		 341 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4094  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4033  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0064  L-threonine 3-dehydrogenase  85.04 
 
 		 341 aa  616  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00353875  unclonable  0.000000014689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3988  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3926  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3939  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27746  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4823  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000204753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0097  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0317813  hitchhiker  0.00132916 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0106  L-threonine 3-dehydrogenase  85.34 
 
 		 341 aa  615  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.588963  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3907  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03425  hypothetical protein  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03474  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0601715  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3828  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0092  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.212636  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4144  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.498759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4044  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.100127  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3953  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  610  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0503034  normal  0.824331 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0066  L-threonine 3-dehydrogenase  83.87 
 
 		 341 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0072  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  613  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0089  L-threonine 3-dehydrogenase  83.87 
 
 		 341 aa  609  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4673  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3901  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00409651  normal  0.55097 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3993  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00526956  normal  0.0228585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3902  L-threonine 3-dehydrogenase  84.16 
 
 		 341 aa  608  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00646337  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4120  L-threonine 3-dehydrogenase  83.87 
 
 		 341 aa  607  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.357417  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4105  L-threonine 3-dehydrogenase  84.46 
 
 		 341 aa  609  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287848  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0100  L-threonine 3-dehydrogenase  83.87 
 
 		 341 aa  608  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.173553 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1853  L-threonine 3-dehydrogenase  86.59 
 
 		 344 aa  608  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.981388  normal  0.0441816 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4341  L-threonine 3-dehydrogenase  83.58 
 
 		 341 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4989  L-threonine 3-dehydrogenase  83.87 
 
 		 341 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4481  L-threonine 3-dehydrogenase  83.58 
 
 		 341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155025  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4286  L-threonine 3-dehydrogenase  83.58 
 
 		 341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000588728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0057  L-threonine 3-dehydrogenase  83.58 
 
 		 341 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0451496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3616  L-threonine 3-dehydrogenase  82.99 
 
 		 342 aa  599  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00121447  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00067  L-threonine 3-dehydrogenase  80.94 
 
 		 341 aa  590  1e-167  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0062  L-threonine 3-dehydrogenase  81.18 
 
 		 340 aa  586  1e-166  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3944  L-threonine 3-dehydrogenase  77.71 
 
 		 342 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4086  L-threonine 3-dehydrogenase  78.01 
 
 		 343 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0175  L-threonine 3-dehydrogenase  76.25 
 
 		 341 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348381  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4367  L-threonine 3-dehydrogenase  77.42 
 
 		 343 aa  569  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7003  L-threonine 3-dehydrogenase  77.35 
 
 		 343 aa  564  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0007  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.237262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0006  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4535  L-threonine 3-dehydrogenase  76.18 
 
 		 342 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1512  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3178  L-threonine 3-dehydrogenase  76.76 
 
 		 342 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0006  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  559  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3020  L-threonine 3-dehydrogenase  76.47 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0530  L-threonine 3-dehydrogenase  77.13 
 
 		 345 aa  559  1e-158  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5157  L-threonine 3-dehydrogenase  76.18 
 
 		 342 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4973  L-threonine 3-dehydrogenase  76.76 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.554494  normal  0.41171 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5702  L-threonine 3-dehydrogenase  76.18 
 
 		 342 aa  557  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00495023 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3116  L-threonine 3-dehydrogenase  76.47 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.717555 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1152  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1432  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.263737  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.936478  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5320  L-threonine 3-dehydrogenase  76.18 
 
 		 342 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0006  L-threonine 3-dehydrogenase  75.88 
 
 		 343 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4160  L-threonine 3-dehydrogenase  76.47 
 
 		 342 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3793  L-threonine 3-dehydrogenase  74.41 
 
 		 341 aa  548  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00257874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0449  L-threonine 3-dehydrogenase  73.98 
 
 		 361 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.333655 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2686  L-threonine 3-dehydrogenase  71.26 
 
 		 345 aa  532  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00603723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1862  L-threonine 3-dehydrogenase  70.09 
 
 		 345 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2095  L-threonine 3-dehydrogenase  70.09 
 
 		 345 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1783  L-threonine 3-dehydrogenase  69.79 
 
 		 345 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1995  L-threonine 3-dehydrogenase  68.91 
 
 		 348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.271324  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0201  L-threonine 3-dehydrogenase  68.91 
 
 		 342 aa  514  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0739  L-threonine 3-dehydrogenase  67.35 
 
 		 340 aa  512  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2931  L-threonine 3-dehydrogenase  68.62 
 
 		 343 aa  512  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.217588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0757  L-threonine 3-dehydrogenase  67.06 
 
 		 340 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2958  L-threonine 3-dehydrogenase  67.65 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.108215  normal  0.634974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2700  L-threonine 3-dehydrogenase  66.76 
 
 		 345 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2076  L-threonine 3-dehydrogenase  64.81 
 
 		 342 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0654334  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0444  L-threonine 3-dehydrogenase  65.29 
 
 		 344 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2224  L-threonine 3-dehydrogenase  65.29 
 
 		 344 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2661  L-threonine 3-dehydrogenase  62.87 
 
 		 346 aa  464  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2923  L-threonine 3-dehydrogenase  63.34 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0806  L-threonine 3-dehydrogenase  61.76 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.384791  normal  0.0311544 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02513  L-threonine 3-dehydrogenase  60.88 
 
 		 344 aa  450  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1594  L-threonine 3-dehydrogenase  61.11 
 
 		 342 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.073313  normal  0.583452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0050  L-threonine 3-dehydrogenase  60.59 
 
 		 347 aa  448  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0049  L-threonine 3-dehydrogenase  59.71 
 
 		 347 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000160501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2797  L-threonine 3-dehydrogenase  58.24 
 
 		 343 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.242425  normal  0.760351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8852  L-threonine 3-dehydrogenase  57.65 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1899  L-threonine 3-dehydrogenase  57.35 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.198837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2377  L-threonine 3-dehydrogenase  57.35 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1037  L-threonine 3-dehydrogenase  57.35 
 
 		 341 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.210217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0233  L-threonine 3-dehydrogenase  60 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.43371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3023  L-threonine 3-dehydrogenase  58.53 
 
 		 348 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473403  normal  0.701742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7063  L-threonine 3-dehydrogenase  57.65 
 
 		 344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1310  L-threonine 3-dehydrogenase  52.02 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1353  L-threonine 3-dehydrogenase  52.17 
 
 		 348 aa  386  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000813951 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1028  L-threonine 3-dehydrogenase  52.46 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>