57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0743 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 414 aa  834    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  38.46 
 
 		 415 aa  250  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  34.1 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  37.17 
 
 		 439 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  45.95 
 
 		 608 aa  77.8  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  29.34 
 
 		 464 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  40.86 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  26.3 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  39.29 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  36.63 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  39.13 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  30.43 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  33.02 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  33.01 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  33.01 
 
 		 449 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  35.42 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  34.95 
 
 		 482 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  22.46 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  41.46 
 
 		 769 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  25.43 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  35.96 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  23.36 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  27.6 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  27.98 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  41.77 
 
 		 709 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  34.78 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  25.62 
 
 		 360 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  41.18 
 
 		 203 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  36.67 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  36 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  35.37 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  33.33 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  25 
 
 		 736 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 478 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  40.48 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  34.44 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  49.02 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  32.93 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  22.22 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  23.36 
 
 		 976 aa  50.8  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  33.01 
 
 		 353 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  35.29 
 
 		 352 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2919  putative ATPase  31.03 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.741445  hitchhiker  0.00681239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2713  hypothetical protein  37.63 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  36.59 
 
 		 580 aa  46.6  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1005  hypothetical protein  30.48 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.729513  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  34.09 
 
 		 623 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0989  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  45.8  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.613523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1783  hypothetical protein  26.32 
 
 		 447 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6914  initiation factor 2 associated domain-containing protein  25.6 
 
 		 680 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.622246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  29.51 
 
 		 452 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  45.24 
 
 		 670 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  29.7 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1584  putative EA59 gene protein, phage lambda  33.61 
 
 		 540 aa  43.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0818233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 492 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>