29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0728 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0728  condesin subunit E  100 
 
 		 238 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231658  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003935  chromosome partition protein MukE  78.15 
 
 		 241 aa  352  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01588  condesin subunit E  78.15 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1318  condesin subunit E  80.28 
 
 		 231 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2566  condesin subunit E  69.9 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2656  condesin subunit E  69.9 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1724  condesin subunit E  69.9 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1970  condesin subunit E  69.9 
 
 		 251 aa  301  5.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1058  condesin subunit E  65.33 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.422947  normal  0.0421691 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1107  condesin subunit E  65.33 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1091  condesin subunit E  65.33 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.802381  normal  0.281458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2197  condesin subunit E  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00300903  normal  0.107372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1084  condesin subunit E  68.93 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000126764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0999  condesin subunit E  68.93 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.029339  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1026  condesin subunit E  68.93 
 
 		 243 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528099  normal  0.462438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2401  condesin subunit E  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.041151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2673  condesin subunit E  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000253852  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1022  condesin subunit E  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000226094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1030  condesin subunit E  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0304428  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2720  chromosome segregation and condensation protein MukE  68.93 
 
 		 234 aa  299  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000671612  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00927  condesin subunit E  68.93 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0268027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00934  hypothetical protein  68.93 
 
 		 225 aa  299  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0256751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1778  condesin subunit E  68.63 
 
 		 240 aa  292  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2199  condesin subunit E  70.15 
 
 		 238 aa  291  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2300  condesin subunit E  68.66 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608848  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2050  condesin subunit E  68.14 
 
 		 240 aa  289  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.135973  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0865  condesin subunit E  67.16 
 
 		 247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00171944  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1442  condesin subunit E  69.42 
 
 		 234 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2096  thioredoxin-disulfide reductase  30.51 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184579  hitchhiker  0.00271395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>