26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0697 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0697  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  613  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147007  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1477  hypothetical protein  43.96 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.235152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003995  hypothetical protein  44.52 
 
 
243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.910417  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01527  hypothetical protein  41.81 
 
 
242 aa  209  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2512  hypothetical protein  28.14 
 
 
333 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018403  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2254  hypothetical protein  29.31 
 
 
332 aa  100  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1810  hypothetical protein  28.95 
 
 
312 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000100473  normal  0.0432271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2396  hypothetical protein  27.76 
 
 
333 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000113685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1951  hypothetical protein  27.38 
 
 
333 aa  99  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000771271  normal  0.269497 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2407  hypothetical protein  28.14 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000906332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2290  hypothetical protein  26.72 
 
 
341 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000825064  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2159  hypothetical protein  27.07 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.133255  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1729  hypothetical protein  26.29 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.414715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2834  hypothetical protein  28.26 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000562067  hitchhiker  0.000583548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1329  hypothetical protein  25.38 
 
 
394 aa  89.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.50236  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1809  hypothetical protein  26.29 
 
 
342 aa  89  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.688217  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1542  hypothetical protein  26.07 
 
 
335 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000050026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2400  hypothetical protein  25.83 
 
 
330 aa  87.8  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000014454  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1673  hypothetical protein  25.65 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000117038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2205  hypothetical protein  24.76 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0128362  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1629  hypothetical protein  27.9 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000041783  normal  0.218366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1795  hypothetical protein  20.83 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00014706  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1724  hypothetical protein  20.87 
 
 
475 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0634806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2138  putative lipoprotein  24.58 
 
 
565 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1258  hypothetical protein  40.38 
 
 
268 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1801  hypothetical protein  51.72 
 
 
222 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>