124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0620 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  100 
 
 
378 aa  764  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  45.03 
 
 
383 aa  337  1e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  46.96 
 
 
382 aa  315  1e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  47.37 
 
 
383 aa  311  8e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  42.89 
 
 
395 aa  285  1e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 
381 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  38.61 
 
 
379 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  38.5 
 
 
383 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  38.23 
 
 
381 aa  254  2e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  37.95 
 
 
382 aa  249  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  36.65 
 
 
383 aa  249  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  36.91 
 
 
383 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  36.91 
 
 
383 aa  248  9e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  38.23 
 
 
378 aa  245  1e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  36.15 
 
 
381 aa  244  2e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  38.3 
 
 
384 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 
392 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  38.11 
 
 
386 aa  237  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
384 aa  232  8e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  36.87 
 
 
397 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 
382 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 
381 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  30.97 
 
 
397 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  29.74 
 
 
780 aa  176  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  26.05 
 
 
395 aa  171  1e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 
367 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
377 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 
496 aa  163  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.41 
 
 
405 aa  149  1e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  28.16 
 
 
375 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  27.75 
 
 
377 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  26.59 
 
 
377 aa  134  2e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  28.97 
 
 
293 aa  133  5e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  25.68 
 
 
379 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 
390 aa  85.1  2e-15  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  28.37 
 
 
378 aa  84  5e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 
376 aa  80.9  3e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  21.55 
 
 
379 aa  78.6  2e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 
391 aa  76.6  7e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  27.74 
 
 
371 aa  76.6  7e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.55 
 
 
387 aa  74.7  2e-12  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  30.38 
 
 
395 aa  75.1  2e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.16 
 
 
372 aa  73.6  6e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  25.34 
 
 
362 aa  72.8  1e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  24.7 
 
 
395 aa  72  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 
380 aa  70.9  4e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.03 
 
 
382 aa  68.9  1e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  22.76 
 
 
375 aa  67.8  3e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  26 
 
 
384 aa  64.3  3e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  63.5  5e-09  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  22.88 
 
 
402 aa  62.8  9e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  21.19 
 
 
405 aa  62.8  1e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  21.33 
 
 
374 aa  62.8  1e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  20.22 
 
 
407 aa  61.6  2e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  21.66 
 
 
383 aa  62  2e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  22.67 
 
 
384 aa  60.8  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  22.75 
 
 
379 aa  61.2  3e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  24.84 
 
 
491 aa  61.2  3e-08  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
405 aa  60.8  3e-08  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  20.1 
 
 
415 aa  60.8  4e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25 
 
 
435 aa  60.5  5e-08  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 
387 aa  60.1  6e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
405 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
430 aa  58.9  1e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 
405 aa  58.2  2e-07  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25 
 
 
430 aa  58.2  2e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 
417 aa  57.8  3e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  20.12 
 
 
397 aa  57.8  3e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
429 aa  56.6  6e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  24.56 
 
 
429 aa  56.6  7e-07  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  23.98 
 
 
408 aa  56.6  8e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  21.74 
 
 
391 aa  56.2  9e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
387 aa  55.5  1e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  24.36 
 
 
431 aa  55.8  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  25 
 
 
378 aa  54.3  4e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  20.07 
 
 
379 aa  53.1  8e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  25 
 
 
378 aa  52.8  9e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  25.29 
 
 
378 aa  52.4  1e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
389 aa  52.4  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.09 
 
 
376 aa  51.6  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  21.15 
 
 
390 aa  52  2e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  19.88 
 
 
380 aa  52  2e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  22.22 
 
 
390 aa  52  2e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  23.03 
 
 
384 aa  51.2  3e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  19.8 
 
 
371 aa  51.2  3e-05  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 
384 aa  51.2  3e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  25 
 
 
395 aa  50.8  4e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.39 
 
 
384 aa  50.1  6e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  20.72 
 
 
399 aa  49.7  8e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  20.61 
 
 
372 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  20.88 
 
 
378 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  20.18 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  22.47 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  24.06 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1794  hypothetical protein  21.65 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  1.52274e-05  normal  0.41124 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  20.49 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  31.58 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  26.42 
 
 
373 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.42 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  18.62 
 
 
371 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>