128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0619 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  100 
 
 
378 aa  768  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  38.12 
 
 
395 aa  262  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  38.51 
 
 
362 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  37.1 
 
 
387 aa  259  7e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  40.91 
 
 
395 aa  257  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  32.98 
 
 
372 aa  212  8e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  32.66 
 
 
371 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  30.14 
 
 
435 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 
429 aa  174  3e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
429 aa  173  3e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 
431 aa  172  6e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  32.76 
 
 
375 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 
387 aa  170  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
390 aa  170  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
405 aa  165  1e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
430 aa  165  1e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  32.08 
 
 
390 aa  164  2e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
387 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
405 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 
408 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 
430 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  31.5 
 
 
384 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
391 aa  135  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  27.52 
 
 
434 aa  131  2e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  29.54 
 
 
402 aa  130  4e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
395 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 
780 aa  113  7e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  26.23 
 
 
417 aa  113  7e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  23.84 
 
 
379 aa  110  6e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  23.12 
 
 
383 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  26.63 
 
 
379 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  25.61 
 
 
383 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  25.52 
 
 
391 aa  96.3  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0652  hypothetical protein  34.27 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  24.34 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
395 aa  90.1  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  23.99 
 
 
397 aa  89.7  7e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  24.47 
 
 
496 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  24.13 
 
 
405 aa  87  5e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  29.74 
 
 
382 aa  85.9  1e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
376 aa  84.3  4e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  23.23 
 
 
382 aa  84  4e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  28.37 
 
 
378 aa  84  5e-15  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  25.45 
 
 
383 aa  82.4  1e-14  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  23.95 
 
 
389 aa  81.3  2e-14  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 
367 aa  81.6  2e-14  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  30.63 
 
 
381 aa  81.6  2e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  25.09 
 
 
395 aa  81.3  2e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
384 aa  80.9  4e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  27.85 
 
 
386 aa  79  1e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
383 aa  77.4  4e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
379 aa  77  5e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  25.08 
 
 
390 aa  76.3  9e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 
381 aa  75.9  1e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  26.15 
 
 
377 aa  75.1  2e-12  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  29.75 
 
 
381 aa  74.3  3e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 
382 aa  73.2  7e-12  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  25.08 
 
 
390 aa  73.2  8e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 
383 aa  72.4  1e-11  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  28.48 
 
 
383 aa  72.4  1e-11  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  28.76 
 
 
383 aa  72.4  1e-11  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
377 aa  71.6  2e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  28.48 
 
 
378 aa  72  2e-11  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  25.57 
 
 
377 aa  69.7  8e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 
384 aa  69.3  9e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
392 aa  69.3  1e-10  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0500  ABC-2 type transporter  22.26 
 
 
384 aa  67.4  4e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 
397 aa  64.3  3e-09  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 
379 aa  64.3  3e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  28.48 
 
 
378 aa  62.8  9e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  27.54 
 
 
381 aa  62.4  1e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  23.9 
 
 
375 aa  61.2  3e-08  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  26.47 
 
 
382 aa  61.2  3e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  23.4 
 
 
381 aa  60.5  4e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.06 
 
 
365 aa  60.5  5e-08  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.31089e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 
378 aa  59.7  7e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  30.25 
 
 
378 aa  60.1  7e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1248  ABC transporter, permease protein  21.41 
 
 
382 aa  59.3  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  24.05 
 
 
911 aa  58.9  1e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  21.78 
 
 
390 aa  57.4  4e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  23.1 
 
 
375 aa  57  6e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001402  ABC-type multidrug transport system permease component  21.98 
 
 
366 aa  57  6e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
380 aa  55.5  2e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  23.08 
 
 
906 aa  54.7  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  21.67 
 
 
384 aa  54.3  4e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  22.12 
 
 
378 aa  53.9  5e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  22.15 
 
 
371 aa  52.4  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
373 aa  52  2e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  22.52 
 
 
368 aa  52  2e-05  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  19.67 
 
 
382 aa  51.6  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4310  ABC-2 type transporter  21.41 
 
 
390 aa  51.2  3e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
373 aa  50.4  5e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
373 aa  50.4  5e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
373 aa  50.4  5e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  22.39 
 
 
914 aa  49.7  8e-05  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  19.63 
 
 
367 aa  49.7  9e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  21.38 
 
 
378 aa  49.7  9e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  25 
 
 
901 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  22.74 
 
 
370 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>