More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0618 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  100 
 
 		 326 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  70.44 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  65.74 
 
 		 324 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  65.81 
 
 		 332 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  69.52 
 
 		 326 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  57.23 
 
 		 324 aa  384  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  57.23 
 
 		 324 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  57.23 
 
 		 324 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  56.51 
 
 		 324 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  60.2 
 
 		 323 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  53.4 
 
 		 329 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  55.7 
 
 		 324 aa  370  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  53.89 
 
 		 324 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  53.58 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  53.58 
 
 		 324 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  55.73 
 
 		 323 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  59.55 
 
 		 332 aa  359  4e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  53.27 
 
 		 324 aa  358  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  58.6 
 
 		 330 aa  353  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  54.55 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  52.81 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  54.22 
 
 		 322 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  39.88 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 427 aa  236  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  42.24 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  43.38 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  44.3 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  36.7 
 
 		 357 aa  218  8.999999999999998e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  37.37 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  37.37 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  37.02 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  39.37 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  30.74 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  30.74 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  30.97 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  31.42 
 
 		 323 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  31.31 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  28.11 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  27.05 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 334 aa  99.4  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  26.96 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.07 
 
 		 462 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  29.15 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.22 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  25.62 
 
 		 357 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  24.68 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  23.86 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1013  secretion protein HlyD  23.81 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  26.64 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.17 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.21 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.13 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5882  secretion protein HlyD family protein  26.76 
 
 		 357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2925  secretion protein HlyD family protein  26.62 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  28.27 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.17 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  28.27 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  23.13 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1147  secretion protein HlyD family protein  25.88 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000143256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  24.21 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  27.85 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.48 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  25.38 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00129  probable membrane fusion protein (HlyD family of secretion proteins) linked to ABC efflux pumps  24.9 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000116655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  23.83 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  26.72 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1611  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.306933  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.18 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  25.78 
 
 		 359 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  21.79 
 
 		 329 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 357 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  25.75 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44200  multidrug efflux pump membrane fusion protein  25.09 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.08 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  24.52 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  22.26 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.35 
 
 		 509 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1711  secretion protein HlyD  26.42 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  23.5 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3107  secretion protein HlyD family protein  26.75 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.128244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.62 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  23.14 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.93 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1744  HlyD family secretion protein  25.52 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0223446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.11 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  25.1 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  21.89 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3131  secretion protein HlyD  24.07 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0978227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1739  secretion protein HlyD  23.55 
 
 		 381 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6454  secretion protein HlyD family protein  24.44 
 
 		 386 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.134299 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2839  secretion protein HlyD family protein  25.17 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>