88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0604 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0604  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  263  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.527043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1545  hypothetical protein  36.15 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.353518  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1890  hypothetical protein  35.14 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0199  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.84429  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0352  hypothetical protein  34.59 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.111379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0396  protein of unknown function DUF583  34.59 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0446304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4166  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4192  hypothetical protein  32.52 
 
 		 210 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719656  hitchhiker  0.00623524 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4236  hypothetical protein  32.52 
 
 		 223 aa  67  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0799  hypothetical protein  35.9 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1996  hypothetical protein  30.33 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.775695  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2641  hypothetical protein  30.09 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0670539  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2611  hypothetical protein  33.59 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.135268  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2678  hypothetical protein  33.59 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.185603  hitchhiker  0.000395785 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1614  protein of unknown function DUF583  29.55 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1662  hypothetical protein  35.29 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0607  protein of unknown function DUF583  28.18 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0628  hypothetical protein  28.18 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2785  hypothetical protein  36.27 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.668707  hitchhiker  0.00289407 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0637  hypothetical protein  28.44 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1040  conserved hypothetical protein (DUF583 domain protein)  28.7 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1954  hypothetical protein  28.7 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0585612  normal  0.0588157 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1325  hypothetical protein  28.18 
 
 		 119 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1475  hypothetical protein  30.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000135685  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1480  hypothetical protein  30.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000228441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2872  protein of unknown function DUF583  30.48 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000301369  hitchhiker  0.000000894597 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04806  cell shape determination protein CcmA  33.73 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0331  protein of unknown function DUF583  34.02 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.198743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1511  hypothetical protein  30.48 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0283593  normal  0.818291 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1317  protein of unknown function DUF583  31.58 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.080306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3685  hypothetical protein  32.48 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.275009  normal  0.0102541 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1382  hypothetical protein  32.69 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2122  protein of unknown function DUF583  30.09 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3528  hypothetical protein  29.7 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.195767 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0724  hypothetical protein  23.62 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1104  hypothetical protein  28.26 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1331  hypothetical protein  32.2 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4436  protein of unknown function DUF583  27.19 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1229  hypothetical protein  28.26 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.043612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2564  hypothetical protein  32.08 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2691  hypothetical protein  31.96 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0493  hypothetical protein  24.55 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3154  hypothetical protein  23.48 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00965778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0384  protein of unknown function DUF583  24.55 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.215983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23470  cell shape determination protein CcmA  30.53 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000002252  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0369  protein of unknown function DUF583  24.55 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1867  hypothetical protein  26.02 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.022153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0191  protein of unknown function DUF583  26.61 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3449  hypothetical protein  26.36 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0234492 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0042  protein of unknown function DUF583  36.78 
 
 		 128 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0178  hypothetical protein  22 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0470  hypothetical protein  26.36 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000860972  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0736  hypothetical protein  27.5 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00177042  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08500  hypothetical protein  34.15 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000020428 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0548  hypothetical protein  30.28 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0350066  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5271  protein of unknown function DUF583  32.93 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.086995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2923  protein of unknown function DUF583  33.68 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1630  protein of unknown function DUF583  32.93 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4734  hypothetical protein  24.31 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122203  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1303  hypothetical protein  28.43 
 
 		 184 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.802702 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1567  hypothetical protein  26.92 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0615  hypothetical protein  26.25 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174199  hitchhiker  0.000000485982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0805  hypothetical protein  34.15 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2165  hypothetical protein  27.84 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4257  hypothetical protein  26.04 
 
 		 171 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1784  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.517753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1713  protein of unknown function DUF583  27.84 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0991  hypothetical protein  27.59 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0189849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6606  protein of unknown function DUF583  33.67 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.154493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2578  hypothetical protein  25.71 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5896  protein of unknown function DUF583  25 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4110  hypothetical protein  23.68 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3931  hypothetical protein  26.32 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.183778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2174  hypothetical protein  24.49 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0413  hypothetical protein  24.55 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00223609  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1854  hypothetical protein  26.8 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.303394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4050  hypothetical protein  26.26 
 
 		 118 aa  42  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802123 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0062  hypothetical protein  26.6 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2104  hypothetical protein  23 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.724366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2975  hypothetical protein  26.8 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1621  hypothetical protein  26.8 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1088  hypothetical protein  25.53 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3137  hypothetical protein  25.61 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0835  hypothetical protein  34.38 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000885875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1431  hypothetical protein  21.9 
 
 		 151 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000096503  normal  0.140917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2189  hypothetical protein  28.12 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2787  hypothetical protein  28.85 
 
 		 191 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.78265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1175  protein of unknown function DUF583  26.92 
 
 		 185 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0118209  normal  0.643318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>