181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0583 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  61.37 
 
 		 553 aa  670    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  59.89 
 
 		 552 aa  661    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  61.64 
 
 		 553 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  100 
 
 		 546 aa  1132    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  42.77 
 
 		 498 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  42.64 
 
 		 498 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  42.19 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  40.49 
 
 		 499 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  43.8 
 
 		 498 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  43.3 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.41 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  59.11 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  43.3 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  42.83 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  42.69 
 
 		 498 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  42.83 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  40.68 
 
 		 499 aa  380  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  43.02 
 
 		 498 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  43.3 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  58.79 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  61.54 
 
 		 523 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  42.64 
 
 		 498 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  43.3 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  55.45 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  55.45 
 
 		 512 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  55.45 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  43.12 
 
 		 468 aa  352  8.999999999999999e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  47.04 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  47 
 
 		 530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.52 
 
 		 528 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  41.56 
 
 		 526 aa  257  4e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  41.91 
 
 		 560 aa  240  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  42.28 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  41.98 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  44.6 
 
 		 489 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  41.82 
 
 		 506 aa  223  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  39.53 
 
 		 498 aa  223  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.31 
 
 		 375 aa  222  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  44.64 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  40.55 
 
 		 547 aa  216  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  45.2 
 
 		 466 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  39.93 
 
 		 382 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  39.22 
 
 		 389 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.49 
 
 		 407 aa  179  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.89 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.41 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  36.68 
 
 		 376 aa  163  7e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  38.54 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.33 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.32 
 
 		 387 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.71 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  34.69 
 
 		 368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  38.51 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  35.2 
 
 		 368 aa  111  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  37.5 
 
 		 368 aa  110  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  35.12 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5532  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.43 
 
 		 319 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2094  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.38 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.640713  normal  0.885504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0725  ATPase  24.9 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1639  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.03 
 
 		 302 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.859939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.2 
 
 		 306 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2906  hypothetical protein  25.32 
 
 		 335 aa  56.6  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.106091  normal  0.402062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.2 
 
 		 306 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1125  ATPase  24.21 
 
 		 332 aa  55.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0786  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.54 
 
 		 333 aa  53.9  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.112127 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0233  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.01 
 
 		 325 aa  53.9  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  26.63 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  26.63 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  26.63 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  26.63 
 
 		 310 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3671  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.58 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3493  ATPase  26.64 
 
 		 356 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  28.07 
 
 		 310 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0805  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.61 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.485502 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.14 
 
 		 319 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.03 
 
 		 341 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2275  ATPase  25.42 
 
 		 337 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.225446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.4 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.04 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.63 
 
 		 309 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.23 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2774  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.98 
 
 		 351 aa  50.8  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335282  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  23.85 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  22.89 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.4 
 
 		 336 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  24.73 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  23.91 
 
 		 313 aa  50.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2146  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25.26 
 
 		 327 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  22.88 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  22.88 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  22.88 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2179  ATPase  23.27 
 
 		 340 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2065  ATPase AAA-2 domain protein  36.73 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.812817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  22.74 
 
 		 309 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  24.56 
 
 		 308 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0320  ATPase  26.63 
 
 		 310 aa  49.3  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  24.26 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0535  ATPase  24.28 
 
 		 313 aa  49.3  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000789925  normal  0.392501 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0207  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  25 
 
 		 333 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  22.71 
 
 		 336 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>