More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0504 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  47.75 
 
 		 989 aa  914    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  100 
 
 		 997 aa  2047    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  35.12 
 
 		 971 aa  549  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  25.47 
 
 		 994 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  26.53 
 
 		 987 aa  194  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  35.95 
 
 		 674 aa  85.5  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  36.84 
 
 		 738 aa  83.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  38.69 
 
 		 774 aa  81.6  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  31.58 
 
 		 756 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  38.52 
 
 		 771 aa  79.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  33.75 
 
 		 679 aa  79  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  36.69 
 
 		 774 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  36.96 
 
 		 946 aa  74.3  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  34.97 
 
 		 723 aa  74.3  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  33.56 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  33.88 
 
 		 796 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  31.37 
 
 		 720 aa  66.6  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2194  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.3 
 
 		 452 aa  64.3  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.514859 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  33.06 
 
 		 609 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  30.94 
 
 		 684 aa  61.6  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  24.86 
 
 		 784 aa  60.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  30.83 
 
 		 719 aa  60.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0326  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.159286  normal  0.343021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 602 aa  58.9  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  30.7 
 
 		 651 aa  58.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  25.12 
 
 		 783 aa  57.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  36.84 
 
 		 773 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 933 aa  57  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  26.52 
 
 		 673 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  30.89 
 
 		 702 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2025  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 452 aa  56.2  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 557 aa  55.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.77 
 
 		 598 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1776  histidine kinase  27.24 
 
 		 519 aa  55.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  36.59 
 
 		 605 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.78 
 
 		 363 aa  55.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  30.47 
 
 		 662 aa  54.7  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1832  histidine kinase  33.87 
 
 		 550 aa  54.3  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 494 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.974463  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4705  sensory box sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 472 aa  53.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  29.69 
 
 		 608 aa  53.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 597 aa  53.5  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4382  histidine kinase  31.62 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4226  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 613 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.58 
 
 		 823 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  31.13 
 
 		 506 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  36.04 
 
 		 621 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 827 aa  53.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  26.05 
 
 		 382 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  32.54 
 
 		 860 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 		 607 aa  52.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 494 aa  52.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  26.04 
 
 		 249 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0488  histidine kinase  25.77 
 
 		 250 aa  52.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.01 
 
 		 523 aa  52.4  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.437577  normal  0.697312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0721  hypothetical protein  34.78 
 
 		 246 aa  51.6  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0783179  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  42.5 
 
 		 626 aa  51.6  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5165  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 593 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0687  ATP-binding region ATPase domain protein  30.56 
 
 		 813 aa  51.6  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 518 aa  51.2  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  23.21 
 
 		 572 aa  51.2  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  31.53 
 
 		 667 aa  51.2  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 1061 aa  50.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  23.21 
 
 		 572 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  25.86 
 
 		 600 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 578 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 516 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 467 aa  50.8  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  42.5 
 
 		 621 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 573 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3850  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 371 aa  50.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 		 921 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 627 aa  50.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0986  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 487 aa  50.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 730 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2643  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 552 aa  50.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 630 aa  50.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  35.19 
 
 		 615 aa  50.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  29.31 
 
 		 742 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  27.4 
 
 		 419 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  41.25 
 
 		 685 aa  49.7  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  26.67 
 
 		 463 aa  49.7  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 628 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  28 
 
 		 671 aa  49.7  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 1062 aa  49.7  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 652 aa  49.3  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  31 
 
 		 635 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 526 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 705 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 658 aa  49.7  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  26.67 
 
 		 642 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 589 aa  49.7  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  30.77 
 
 		 603 aa  49.7  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0076  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 427 aa  49.3  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000670582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0568  histidine kinase  32.61 
 
 		 237 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 1055 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.35 
 
 		 480 aa  49.3  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 611 aa  49.3  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 416 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>