126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0490 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0490  putative thiaminase (transcriptional activator TenA)  100 
 
 
220 aa  457  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.610131  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000867  thiaminase II  72.02 
 
 
220 aa  338  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06842  transcriptional regulator  71.56 
 
 
222 aa  337  9e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2374  transcriptional activator  66.36 
 
 
226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0151  transcriptional activator, TenA family  48.84 
 
 
236 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3122  TenA family transcription regulator  49.28 
 
 
226 aa  191  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0406  transcriptional activator, TenA family  45.97 
 
 
234 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.23459 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2025  TenA family transcription regulator  46.41 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0858  TENA/THI-4 protein  43.66 
 
 
220 aa  181  6e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.162996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2677  TenA family transcription regulator  44.65 
 
 
219 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3186  transcriptional activator, TenA family  43.26 
 
 
219 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2663  TenA family transcription regulator  43.72 
 
 
219 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387648  normal  0.982111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2530  TenA family transcription regulator  43.26 
 
 
221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1209  TenA family transcription regulator  41.23 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0279  TenA family transcription regulator  41.67 
 
 
231 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0908  transcriptional activator  42.79 
 
 
232 aa  167  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.156653  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0212  transcriptional regulator TenA, putative  42.11 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00130  phosphomethylpyrimidine kinase, putative  38.89 
 
 
561 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.45662  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0203  putative transcriptional regulator TenA  42.11 
 
 
232 aa  164  8e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.608084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0035  TenA family transcription regulator  44.76 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3656  TenA family transcription regulator  44.5 
 
 
225 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.754332  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10762  thiamin biosynthesis protein (Thi-4), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10740)  40.38 
 
 
510 aa  148  8e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.116224  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0466  TenA/Thi-4 family protein  34.11 
 
 
221 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1497  TenA/Thi-4 family protein  33.64 
 
 
222 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0491  TenA/Thi-4 family protein  33.64 
 
 
221 aa  142  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2870  transcriptional activator TenA  29.95 
 
 
221 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0284  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator, TenA/Thi-4-like protein  34.42 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5519  transcriptional activator, TenA family  35.55 
 
 
231 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2482  transcriptional activator, TenA family  31.75 
 
 
222 aa  112  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0684  transcriptional activator, TenA family  31.28 
 
 
221 aa  111  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2987  transcriptional activator, TenA family  32.34 
 
 
221 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1351  TenA family transcription regulator  31.13 
 
 
226 aa  102  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000186678  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2707  transcriptional activator, TenA family  29.36 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2784  TenA family transcription regulator  29.3 
 
 
223 aa  97.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.349831  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0869  transcriptional activator, TenA family  27.78 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4829  transcriptional activator, TenA family  33.33 
 
 
216 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0612  TenA family transcription regulator  28.57 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.741623  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70077  Phosphomethylpyrimidine kinase THI21 (HMP-phosphate kinase) (HMP-P kinase)  27.43 
 
 
583 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.583202  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0782  putative transcriptional activator TenA  27.88 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.403076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1431  TenA family transcription regulator  31.28 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26969  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0795  transcriptional activator TenA, putative  27.88 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0691  transcriptional activator TenA  27.88 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  27.88 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0725  transcriptional activator TenA  27.88 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00338422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0641  TenA family transcription regulator  26.67 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0879  putative transcriptional activator TenA  27.88 
 
 
231 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00330179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04021  TENA/THI-4 protein  30.41 
 
 
207 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.484099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2973  TenA family transcription regulator  35.37 
 
 
232 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.320066  normal  0.731254 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0635  transcriptional regulator of extracellular enzyme  28.23 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000639213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0357  TenA family transcription regulator  31.09 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0367  TenA family transcription regulator  31.09 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0346  TenA family transcription regulator  31.09 
 
 
229 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0805  TenA family transcription regulator  32 
 
 
213 aa  87  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4549  putative transcriptional activator TenA  27.4 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00503672  normal  0.282706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1028  TenA family transcription regulator  30.41 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1410  transcriptional activator, TenA family  30.19 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1156  transcriptional activator, TenA family  29 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000598897  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4256  transcriptional activator, TenA family  28.72 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0802  putative transcriptional activator TenA  26.92 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15416e-46 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2438  transcriptional activator, TenA family  30.81 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000793245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1007  transcriptional activator, TenA family  31.55 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00691349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4521  transcriptional activator, TenA family  29.59 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0629922  normal  0.0295033 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_88734  predicted protein  30.65 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.6901  normal  0.220592 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0644  transcriptional activator, TenA family  28.5 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0361  TenA family transcriptional activator  28.35 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2439  TenA family transcription regulator  32.78 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576095  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2357  transcriptional activator  27.96 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1892  TenA family transcription regulator  28.44 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0105459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0021  TenA family transcription regulator  30.46 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2629  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378111  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2436  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2391  transcriptional activator  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2611  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.204985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2668  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.358374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2584  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2628  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000192949 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2523  TenA family transcription regulator  27.01 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0025683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2739  transcriptional activator TenA  27.49 
 
 
229 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.376117  hitchhiker  0.00000275014 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0407  transcriptional activator, TenA family  25.58 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3256  TenA family transcription regulator  32.32 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10853  putative transcriptional activator (TenA family)  27.78 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1974  TenA family transcription regulator  27.88 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.547814  hitchhiker  0.000000287748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2138  putative transcriptional activator, TenA family  28.64 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3392  TenA family transcription regulator  29.5 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  0.0978222 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0606  transcriptional activator, TenA family  28.36 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00086118  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1074  TenA family transcription regulator  26.92 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0564389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0097  transcriptional activator, TenA family  28.14 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.658619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0480  TenA family transcription regulator  24.75 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00667061  hitchhiker  0.000776397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3497  transcriptional activator, TenA family  27.86 
 
 
216 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540571  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2953  putative transcriptional regulator  27.23 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1546  putative transcription activator  24.5 
 
 
234 aa  72.8  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260414  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2462  transcriptional activator, TenA family  26.13 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.67745  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1316  TenA family transcription regulator  28.29 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03941  TENA/THI-4 protein  31.33 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.511301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2169  transcriptional activator, TenA family  25.13 
 
 
220 aa  70.1  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03931  TENA/THI-4 protein  30.67 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5262  transcriptional activator, TenA family  29.44 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3844  putative transcriptional activator, TenA family  27.27 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.077878  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0089  transcriptional activator, TenA family  28.57 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  30.61 
 
 
518 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>