More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0486 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
284 aa  570  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  73.61 
 
 
295 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  71.54 
 
 
286 aa  381  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2378  phosphomethylpyrimidine kinase  72.39 
 
 
283 aa  371  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0914  phosphomethylpyrimidine kinase  63.24 
 
 
282 aa  318  9e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0556569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  53.96 
 
 
268 aa  281  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
268 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
268 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 
270 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  53.58 
 
 
264 aa  270  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  52.45 
 
 
269 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  51.53 
 
 
271 aa  268  9e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  50.95 
 
 
266 aa  265  6e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  52.85 
 
 
267 aa  264  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  52.83 
 
 
268 aa  259  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
285 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  259  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
266 aa  259  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  5e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  49.62 
 
 
266 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  258  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  256  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  49.62 
 
 
266 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  52.27 
 
 
268 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  48.85 
 
 
266 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  48.64 
 
 
267 aa  254  8e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  53.23 
 
 
266 aa  254  1e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
268 aa  253  2e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  51.92 
 
 
265 aa  253  2e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  3.85147e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 
277 aa  253  4e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  48.25 
 
 
267 aa  252  4e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  52.63 
 
 
268 aa  251  8e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  50.18 
 
 
272 aa  251  8e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  50.56 
 
 
270 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  50.58 
 
 
269 aa  247  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  45.56 
 
 
267 aa  246  3e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  51.49 
 
 
267 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 
268 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
269 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  52.69 
 
 
269 aa  244  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  52.69 
 
 
269 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  53.08 
 
 
269 aa  244  1e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  53.44 
 
 
268 aa  244  2e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  55.94 
 
 
271 aa  243  2e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  50.96 
 
 
269 aa  242  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  46.49 
 
 
297 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
269 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  48.06 
 
 
267 aa  241  9e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.43 
 
 
262 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
263 aa  240  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  46.9 
 
 
267 aa  239  3e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  239  3e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
266 aa  239  3e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
269 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2095  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
285 aa  239  5e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  51.32 
 
 
269 aa  238  6e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  50.71 
 
 
490 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
266 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  47.47 
 
 
266 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  48.01 
 
 
323 aa  236  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2005  phosphomethylpyrimidine kinase  51.88 
 
 
269 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  51.31 
 
 
267 aa  235  5e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 
270 aa  235  5e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  49.04 
 
 
269 aa  234  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  46.32 
 
 
274 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  50.94 
 
 
267 aa  234  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  47.53 
 
 
264 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
260 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  52.61 
 
 
304 aa  233  4e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4968  phosphomethylpyrimidine kinase  54.72 
 
 
267 aa  232  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.949163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 
264 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  46.18 
 
 
267 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 
277 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  52.24 
 
 
291 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 
270 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  45.98 
 
 
270 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  50.53 
 
 
284 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  48.36 
 
 
264 aa  228  8e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  49.24 
 
 
288 aa  228  8e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  53.03 
 
 
263 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2604  phosphomethylpyrimidine kinase  51.3 
 
 
778 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.354014  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 
264 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  45.42 
 
 
272 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 
285 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.91 
 
 
265 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1958  phosphomethylpyrimidine kinase  53.51 
 
 
271 aa  225  5e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0610158  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  45.21 
 
 
270 aa  225  5e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2516  phosphomethylpyrimidine kinase  51.5 
 
 
269 aa  225  5e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  47.69 
 
 
271 aa  225  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  54.41 
 
 
266 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1014  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 
279 aa  224  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>