More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0433 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  69.25 
 
 		 529 aa  745    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  69.69 
 
 		 523 aa  774    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0433  transporter, BCCT family  100 
 
 		 531 aa  1058    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  70.96 
 
 		 525 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  69.19 
 
 		 535 aa  756    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003138  High-affinity choline uptake protein BetT  69.71 
 
 		 450 aa  652    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000429409  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  59.65 
 
 		 534 aa  663    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  68.41 
 
 		 540 aa  751    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  70.93 
 
 		 526 aa  780    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  69.88 
 
 		 526 aa  774    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  69.62 
 
 		 525 aa  762    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  72.2 
 
 		 526 aa  801    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  59.07 
 
 		 554 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  57.17 
 
 		 535 aa  589  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  58.67 
 
 		 529 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  57.93 
 
 		 539 aa  581  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  54.79 
 
 		 534 aa  568  1e-160  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  54.34 
 
 		 550 aa  549  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  51.3 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  49.27 
 
 		 582 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  50.65 
 
 		 551 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  50.65 
 
 		 551 aa  511  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  48.8 
 
 		 574 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  52.75 
 
 		 548 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2505  choline/carnitine/betaine transporter  51.03 
 
 		 541 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  49.35 
 
 		 553 aa  502  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  49.17 
 
 		 555 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  50.28 
 
 		 554 aa  500  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  50.84 
 
 		 554 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3929  hypothetical protein  50.09 
 
 		 551 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.720842  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  50.19 
 
 		 551 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  47.74 
 
 		 606 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  42.59 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  46.65 
 
 		 545 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 583 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  42.97 
 
 		 538 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  41.81 
 
 		 584 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 		 659 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  42.66 
 
 		 659 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  41.41 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  42.17 
 
 		 667 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  46.68 
 
 		 668 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  44.83 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  44.4 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  44.7 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.74 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  45.29 
 
 		 658 aa  379  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  43.88 
 
 		 691 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  43.93 
 
 		 676 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  43.93 
 
 		 676 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  44.13 
 
 		 673 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  43.51 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 		 682 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  40.87 
 
 		 490 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  44.03 
 
 		 673 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  40.98 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  42.1 
 
 		 567 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  41.53 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  39.72 
 
 		 656 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  43.15 
 
 		 698 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  41.13 
 
 		 646 aa  375  1e-102  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  40.87 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  44.47 
 
 		 658 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.94 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  40.98 
 
 		 661 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  41.1 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  41.1 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  41.1 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  41.6 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  41.51 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  41.1 
 
 		 716 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  44.26 
 
 		 658 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  41.1 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  41.1 
 
 		 676 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  41.1 
 
 		 716 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  43.09 
 
 		 676 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  41.38 
 
 		 682 aa  368  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  43.72 
 
 		 676 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  43.72 
 
 		 676 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  43.65 
 
 		 658 aa  366  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  43.15 
 
 		 658 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  43.24 
 
 		 658 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  42 
 
 		 664 aa  365  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  43.46 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.03 
 
 		 661 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  41.18 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  41.18 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  41.18 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  40.91 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  41.18 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  41.18 
 
 		 505 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  39.14 
 
 		 530 aa  363  5.0000000000000005e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  43.24 
 
 		 658 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  38.82 
 
 		 660 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  40.97 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.97 
 
 		 505 aa  360  4e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  40.97 
 
 		 504 aa  359  6e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  40.75 
 
 		 667 aa  359  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>