50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0396 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0396  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  100 
 
 		 452 aa  939    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0687  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  45.5 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.59 
 
 		 424 aa  294  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0138724 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02168  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.3 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02127  hypothetical protein  37.3 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2383  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.3 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3379  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.53 
 
 		 419 aa  282  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2624  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.3 
 
 		 419 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0201  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.26 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2394  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.5 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2540  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.07 
 
 		 419 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  35.51 
 
 		 432 aa  279  8e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.171516  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1417  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  37.07 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1409  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.07 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.898799  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2806  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.3 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.639346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2629  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.84 
 
 		 419 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.469709 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2513  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.84 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1020  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.24 
 
 		 446 aa  275  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2421  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.84 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2525  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.84 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.84 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.827819  normal  0.481861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3956  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.11 
 
 		 420 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4147  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.79 
 
 		 420 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0228  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.14 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0566  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  37.14 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3990  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  36.57 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.523748  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0249  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  33.64 
 
 		 418 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.084897  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1520  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.38 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0570391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2843  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.77 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00580036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1470  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.09 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3498  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  27.38 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.435749 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0070  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.11 
 
 		 412 aa  144  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1437  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.15 
 
 		 415 aa  143  7e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1229  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.08 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4112  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  23.99 
 
 		 414 aa  133  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.889687  normal  0.0200545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3300  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  25.34 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2517  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  26.21 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.113743 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  24.53 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1124  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  23.61 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3389  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  24.22 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2101  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  24.37 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.20171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0932  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic, B subunit  24.71 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.138789  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1318  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  22.02 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2531  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  22.25 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1420  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  21.79 
 
 		 436 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1337  anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit B  28.81 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.766172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  51.35 
 
 		 396 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.61 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07621  hypothetical protein  26.36 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0179283 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0130  hypothetical protein  26.36 
 
 		 405 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.700212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>