250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0310 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  66.38 
 
 		 700 aa  990    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  65.82 
 
 		 700 aa  981    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  100 
 
 		 703 aa  1432    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  25.53 
 
 		 580 aa  122  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 478 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.42 
 
 		 920 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.96 
 
 		 830 aa  98.2  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  23.08 
 
 		 947 aa  97.4  8e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  23.92 
 
 		 800 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  23.39 
 
 		 827 aa  97.1  9e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  22.68 
 
 		 753 aa  96.7  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  22.22 
 
 		 869 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.73 
 
 		 781 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  24.5 
 
 		 830 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 823 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  22.37 
 
 		 828 aa  90.9  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  24.49 
 
 		 919 aa  89.4  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  22.55 
 
 		 828 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  22.56 
 
 		 828 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.39 
 
 		 897 aa  87.4  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 869 aa  87  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  24.83 
 
 		 919 aa  87  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  25.74 
 
 		 921 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  25.26 
 
 		 910 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  23.76 
 
 		 948 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  24.76 
 
 		 922 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  24.75 
 
 		 912 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  24.54 
 
 		 1055 aa  82.4  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 992 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  24.19 
 
 		 824 aa  80.1  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.54 
 
 		 833 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  24.83 
 
 		 915 aa  79  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  24.09 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 977 aa  78.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 920 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  24.83 
 
 		 952 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  21.18 
 
 		 837 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  26.2 
 
 		 495 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  24.68 
 
 		 473 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.04 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 833 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.94 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  21.48 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  28.1 
 
 		 992 aa  75.5  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  25.43 
 
 		 869 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  21.93 
 
 		 812 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  21.21 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  21.21 
 
 		 837 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  23.43 
 
 		 931 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  25.75 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  26.63 
 
 		 834 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 936 aa  71.2  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  21.15 
 
 		 846 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  28.57 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 849 aa  67.8  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.07 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  24.18 
 
 		 568 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  23.25 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  30.87 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  26 
 
 		 803 aa  65.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3071  polysaccharide export protein  24.14 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.06 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.17 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  31.88 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  31.88 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  31.88 
 
 		 558 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22210  polysaccharide export protein  22.87 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  27.32 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  31.29 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  28.65 
 
 		 333 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  24.23 
 
 		 264 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  27.46 
 
 		 277 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  31.39 
 
 		 281 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  24.17 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  25.44 
 
 		 508 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  24.71 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  31.88 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1769  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  23.83 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  28.93 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0689  polysaccharide export protein, PEP-CTERM sytem-associated  23.75 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.659999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  28.16 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  29.77 
 
 		 392 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  27.39 
 
 		 185 aa  56.6  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  25.6 
 
 		 191 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 387 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  28.14 
 
 		 196 aa  55.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  29.38 
 
 		 606 aa  55.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>