116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0299 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0299  putative glycosyl transferases  100 
 
 
385 aa  796    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003539  glycosyltransferase  49.87 
 
 
374 aa  388  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02222  hypothetical protein  48.21 
 
 
375 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3059  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 
416 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.304674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2210  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 
392 aa  195  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.516379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4703  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 
390 aa  189  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0677  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2641  hypothetical protein  28.9 
 
 
392 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602501  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2727  hypothetical protein  29.16 
 
 
392 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.298348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2822  hypothetical protein  28.9 
 
 
392 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2281  glycosyl transferase, group 1  27.52 
 
 
389 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4204  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 
398 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.186805  normal  0.199136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1753  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
705 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0589133  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0105  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
385 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1819  hypothetical protein  25.64 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000132371  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4118  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
383 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0967144  hitchhiker  0.00000000882956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5260  glycosyltransferase  33.04 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0827  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1195  hypothetical protein  26.33 
 
 
420 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.291365  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2340  glycosyl transferase, group 1  32.24 
 
 
397 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.107482  normal  0.0271805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2459  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
729 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3620  glycosyltransferase  25.27 
 
 
443 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270845  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  27.73 
 
 
814 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0265  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.61 
 
 
427 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0256  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  27.61 
 
 
427 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1306  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 
422 aa  105  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.622401  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1956  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 
397 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454805  hitchhiker  0.000698573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0087  glycosyltransferase  28.29 
 
 
412 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4117  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 
395 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0723713  hitchhiker  0.0000000981139 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2529  hypothetical protein  29.41 
 
 
376 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0280  glycosyl transferase group 1  27.13 
 
 
403 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1496  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
728 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0542283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1400  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 
728 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.527052  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.05 
 
 
1293 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0268  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.1 
 
 
477 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0169  glycosyltransferase-like protein  24.04 
 
 
751 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.672061  normal  0.17945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2692  hypothetical protein  24.09 
 
 
370 aa  96.3  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.65 
 
 
411 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0259  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  26.72 
 
 
477 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.636404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0058  glycosyltransferase-like protein  25.36 
 
 
443 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0199  hypothetical protein  25.49 
 
 
754 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0257  teichuronic acid biosynthesis glycosyl transferase, putative  30.15 
 
 
411 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0141248  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2899  hypothetical protein  28.18 
 
 
394 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.394156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25661  hypothetical protein  25.36 
 
 
741 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3311  glycosyl transferase, group 1  27.24 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4112  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 
385 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19360  hypothetical protein  26.74 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5685  UDP-galactopyranose mutase  26.92 
 
 
783 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.649144  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0179  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 
404 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.160562  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4021  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
382 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5610  UDP-galactopyranose mutase  26.8 
 
 
783 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1929  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  23.26 
 
 
1119 aa  86.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2703  hypothetical protein  25.08 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0632784  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3854  hypothetical protein  26.38 
 
 
407 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3695  methyltransferase type 12  27.9 
 
 
726 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2380  hypothetical protein  26.47 
 
 
434 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0254989  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2279  glycosyl transferase, group 1  23.19 
 
 
382 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1863  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.39 
 
 
378 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0664  hypothetical protein  30.63 
 
 
942 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000150651  hitchhiker  0.00000068678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4319  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
903 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577518  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3716  glycosyl transferase group 1  24.68 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4122  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
393 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0258  glycosyl transferase group 1  24.58 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2394  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0170  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.269733  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1963  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000383254 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0171  hypothetical protein  27.18 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0962  hypothetical protein  26.47 
 
 
378 aa  63.2  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2439  glycosyl transferase, group 1  21.45 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0649  putative glycosyltransferase  30 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408248  normal  0.175721 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 
378 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  24.38 
 
 
394 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  27.43 
 
 
414 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  23.05 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3973  hypothetical protein  22.03 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0754  hypothetical protein  21.55 
 
 
416 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200233  hitchhiker  0.000521831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
397 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0014  glycosyl transferase, group 1  24.9 
 
 
378 aa  53.9  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal  0.0193724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6552  hypothetical protein  19.93 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  25.91 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  25.81 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  27.72 
 
 
723 aa  50.8  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3904  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
374 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6016  hypothetical protein  23.96 
 
 
383 aa  49.7  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1678  glycosyl transferase, group 1  19.35 
 
 
373 aa  49.7  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0348  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
396 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212038  normal  0.421702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1131  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
904 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.845699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  21.6 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
405 aa  47.8  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  22.53 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
416 aa  47  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  26.34 
 
 
398 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
415 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  24.86 
 
 
399 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00701  glycosyl transferase  25.52 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.66 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>