More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0194 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  100 
 
 
461 aa  946  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  56.76 
 
 
457 aa  538  1e-152  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  53.32 
 
 
457 aa  506  1e-142  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 
457 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  36.75 
 
 
471 aa  300  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  34.44 
 
 
468 aa  255  1e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
459 aa  190  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
455 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  33.22 
 
 
455 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.74 
 
 
471 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.37 
 
 
452 aa  174  3e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
389 aa  172  8e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  33.74 
 
 
458 aa  169  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  33.9 
 
 
480 aa  165  2e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  32.2 
 
 
449 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
449 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
449 aa  164  4e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
458 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
458 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
445 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  30.56 
 
 
453 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  31.38 
 
 
458 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
454 aa  158  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  32.48 
 
 
381 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
459 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
463 aa  157  5e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
449 aa  157  5e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
448 aa  157  5e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
467 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
466 aa  154  3e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  28.69 
 
 
458 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  31.63 
 
 
465 aa  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  32.13 
 
 
453 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
457 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
445 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
463 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.64 
 
 
449 aa  150  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  30.28 
 
 
561 aa  148  2e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  31.42 
 
 
416 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
442 aa  147  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
455 aa  147  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  4.04182e-09 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  32.35 
 
 
462 aa  146  8e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
449 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  32.47 
 
 
561 aa  145  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  27.78 
 
 
472 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
455 aa  144  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.9 
 
 
449 aa  143  6e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 
435 aa  143  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  9.971e-12 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  32.05 
 
 
429 aa  143  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 
421 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
563 aa  142  1e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
455 aa  142  1e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
449 aa  141  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
444 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  31.23 
 
 
449 aa  141  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00150  two-component sensor protein  27.93 
 
 
468 aa  140  5e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
471 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  30.09 
 
 
456 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 
472 aa  140  7e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
419 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.13 
 
 
423 aa  139  9e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
427 aa  139  9e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.143276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 
420 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
439 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
469 aa  138  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  31.8 
 
 
465 aa  137  3e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2891  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
433 aa  137  3e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.392127  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  29.69 
 
 
428 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.52 
 
 
433 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
550 aa  136  6e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  24.57 
 
 
446 aa  136  7e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  30.99 
 
 
443 aa  136  9e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3391  histidine kinase  34.51 
 
 
485 aa  135  2e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0812164  normal  0.286483 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002218  copper sensory histidine kinase CpxA  31.58 
 
 
464 aa  135  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00500804  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  28.31 
 
 
433 aa  135  2e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  31.68 
 
 
412 aa  135  2e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  26.51 
 
 
446 aa  134  4e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
429 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.9 
 
 
461 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.0096e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  28.04 
 
 
436 aa  133  7e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  28.04 
 
 
433 aa  133  8e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
523 aa  132  1e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2265  two-component sensor protein  30.99 
 
 
464 aa  132  1e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.6955e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  28.44 
 
 
433 aa  132  1e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  27.78 
 
 
433 aa  132  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  27.78 
 
 
433 aa  132  1e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  28.44 
 
 
433 aa  132  1e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
454 aa  132  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  28.44 
 
 
433 aa  132  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
423 aa  131  2e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  28.44 
 
 
433 aa  132  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.57 
 
 
461 aa  132  2e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  30.85 
 
 
452 aa  132  2e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  29.57 
 
 
461 aa  132  2e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.30471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1795  sensor protein RstB  28.44 
 
 
433 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0023579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3851  two-component sensor protein  30.5 
 
 
456 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257653  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3678  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
376 aa  130  4e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.227613 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0676  histidine kinase  32.29 
 
 
400 aa  130  4e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.887775  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
536 aa  130  5e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  28.57 
 
 
434 aa  130  5e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>