More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0110 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000849  putative ferrichrome-iron receptor  52.58 
 
 		 699 aa  710    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.744816  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06761  hypothetical protein  54.53 
 
 		 690 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  100 
 
 		 693 aa  1424    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  43.34 
 
 		 710 aa  560  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4959  TonB-dependent receptor  43.38 
 
 		 706 aa  554  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  43.34 
 
 		 712 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  40.95 
 
 		 714 aa  538  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  41.9 
 
 		 712 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  40.11 
 
 		 706 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  40.25 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  40.11 
 
 		 706 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4504  TonB-dependent siderophore receptor  39.33 
 
 		 703 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000141313  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  39.18 
 
 		 697 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1814  putative putative ferrichrome-iron receptor  39.61 
 
 		 693 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  39.97 
 
 		 690 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4014  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 709 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00017833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  39.44 
 
 		 709 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 702 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  38.5 
 
 		 701 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3641  TonB-dependent receptor, putative  39.55 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000783326  normal  0.0764781 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  28.61 
 
 		 721 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 		 738 aa  210  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 726 aa  207  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 742 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 742 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 707 aa  203  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 860 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1590  TonB-dependent siderophore receptor  29.46 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 815 aa  201  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 748 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  28.79 
 
 		 748 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1729  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 749 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.775588  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 		 743 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 719 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  28.57 
 
 		 680 aa  192  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 850 aa  191  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 		 696 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 708 aa  190  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  26.81 
 
 		 708 aa  190  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 714 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  26.83 
 
 		 677 aa  189  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.53 
 
 		 710 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 714 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0688  TonB-dependent receptor protein  25.66 
 
 		 716 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  25.99 
 
 		 726 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  28.19 
 
 		 740 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 791 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  26.87 
 
 		 791 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  26.4 
 
 		 703 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 729 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 726 aa  186  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2064  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  27.42 
 
 		 778 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 		 796 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  25.14 
 
 		 719 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  26.82 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 795 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 809 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 796 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 710 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 770 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 		 727 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  25.41 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  26.09 
 
 		 710 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 742 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  26.98 
 
 		 701 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  25.63 
 
 		 708 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  26.22 
 
 		 742 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 837 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 864 aa  178  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 795 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 794 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  26.06 
 
 		 696 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  26.02 
 
 		 696 aa  177  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 736 aa  177  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 820 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 796 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 		 708 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 817 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  25.92 
 
 		 696 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  25.88 
 
 		 696 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  27.3 
 
 		 743 aa  176  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  27.84 
 
 		 796 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 712 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  25.88 
 
 		 696 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.03 
 
 		 706 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  27.72 
 
 		 797 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 		 827 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  25.84 
 
 		 698 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  26.01 
 
 		 716 aa  174  5.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 692 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  25.7 
 
 		 696 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  25.22 
 
 		 695 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 		 715 aa  171  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 718 aa  171  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 829 aa  171  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>