More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0091 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 325 aa  659    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  69.57 
 
 		 324 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  66.36 
 
 		 317 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  68.39 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  62.9 
 
 		 313 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 312 aa  259  6e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  49.35 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  46.77 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  45.78 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  46.77 
 
 		 315 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  47.42 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  45.19 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  46.15 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0795  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02097  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00508947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1490  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02056  hypothetical protein  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00616403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3304  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000243379  normal  0.0139965 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2305  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1480  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00345053  unclonable  0.000000014871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2315  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000477642  hitchhiker  0.000599069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  44.87 
 
 		 312 aa  245  6e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2465  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  245  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000474355  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  44.69 
 
 		 314 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2353  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000249505  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2441  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151265  hitchhiker  0.00000493552 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2444  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105747  normal  0.37193 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2397  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.296088  hitchhiker  0.000165824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  44.69 
 
 		 315 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2555  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0672567  hitchhiker  0.000484792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0822  1-phosphofructokinase  45.83 
 
 		 313 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.866329  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2762  1-phosphofructokinase  45.37 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  45.51 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2682  1-phosphofructokinase  44.55 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000785688  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1525  1-phosphofructokinase  44.55 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0144942  normal  0.0682972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2763  1-phosphofructokinase  44.55 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0176318  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  43.87 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0787  1-phosphofructokinase  42.68 
 
 		 306 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2647  PfkB  43.35 
 
 		 322 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.150018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  41.12 
 
 		 326 aa  206  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  39.34 
 
 		 322 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  36.22 
 
 		 330 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.08 
 
 		 315 aa  185  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0188  1-phosphofructokinase  37.66 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.76 
 
 		 311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1971  PfkB  40.07 
 
 		 327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808112  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  38.66 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  33.55 
 
 		 310 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0907  1-phosphofructokinase  39.8 
 
 		 349 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  34.48 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  34.38 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0434  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 328 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1787  1-phosphofructokinase  37.3 
 
 		 328 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2031  1-phosphofructokinase  36.8 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.832407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  37.21 
 
 		 312 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  33.75 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00488  1-phosphofructokinase  35.45 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  34.91 
 
 		 316 aa  156  6e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.41 
 
 		 308 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  29.35 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0611  1-phosphofructokinase  36.33 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  33.44 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.48 
 
 		 308 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  29.68 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  29.14 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  31.38 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  29.68 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2664  1-phosphofructokinase  36.73 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.877221  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  28.71 
 
 		 307 aa  142  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  30.45 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.41 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  31.65 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  30.45 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  36.67 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  29.94 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  29.11 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  29.87 
 
 		 302 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  29.77 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.45 
 
 		 303 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.13 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.25 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  29.68 
 
 		 310 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  34.58 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  30.34 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3183  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2263  tagatose-6-phosphate kinase  29.35 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.925431  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2224  tagatose-6-phosphate kinase  29.35 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  29.32 
 
 		 315 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  29.9 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4251  ribokinase-like domain-containing protein  33.93 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.598338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  26.5 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  31.03 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  32.33 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  31.31 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  28.57 
 
 		 310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>