67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0010 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0010  hypothetical protein  100 
 
 
547 aa  1115    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.736924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1695  hypothetical protein  35.08 
 
 
562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000996  predicted polymerase  36.38 
 
 
559 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07053  hypothetical protein  35.83 
 
 
566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0158  hypothetical protein  37.57 
 
 
556 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0568  hypothetical protein  30.83 
 
 
556 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.235837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3231  hypothetical protein  32.65 
 
 
556 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3165  hypothetical protein  32.22 
 
 
562 aa  242  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0826  hypothetical protein  32.73 
 
 
563 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0596  hypothetical protein  32.49 
 
 
554 aa  237  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0674  hypothetical protein  33.26 
 
 
563 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0199689 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3273  hypothetical protein  33.26 
 
 
563 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3451  hypothetical protein  31.12 
 
 
563 aa  238  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0113855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3684  hypothetical protein  31.09 
 
 
562 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0539  hypothetical protein  31.98 
 
 
555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3531  hypothetical protein  30.72 
 
 
562 aa  229  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3979  hypothetical protein  30.75 
 
 
556 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0830  protein of unknown function DUF342  30.98 
 
 
562 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000204321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0837  hypothetical protein  30.98 
 
 
562 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0805  hypothetical protein  30.98 
 
 
562 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4141  hypothetical protein  29.41 
 
 
556 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.5265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2978  hypothetical protein  29.14 
 
 
555 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02406  hypothetical protein  26.27 
 
 
551 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122562  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0512  hypothetical protein  28.48 
 
 
546 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2173  hypothetical protein  28.09 
 
 
552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.819375  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3025  hypothetical protein  30.94 
 
 
546 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.487513  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1709  hypothetical protein  28.63 
 
 
534 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3642  hypothetical protein  31.76 
 
 
544 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000393022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0090  protein of unknown function DUF342  25.27 
 
 
565 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0671  protein of unknown function DUF342  29.95 
 
 
545 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38243e-32 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2455  hypothetical protein  26.59 
 
 
538 aa  144  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0872  hypothetical protein  31.32 
 
 
541 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0262539  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0879  hypothetical protein  29.06 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00425584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1663  hypothetical protein  25.92 
 
 
459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000175912  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2682  hypothetical protein  26.4 
 
 
656 aa  107  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1305  protein of unknown function DUF342  25.53 
 
 
530 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.431943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2143  protein of unknown function DUF342  25 
 
 
461 aa  95.1  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0160634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16620  predicted polymerase, contains PALM domain, HD hydrolase domain and Zn-ribbon domain  22.37 
 
 
611 aa  95.1  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0657  hypothetical protein  24.73 
 
 
509 aa  93.6  8e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0473  hypothetical protein  24.45 
 
 
467 aa  93.6  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0498  hypothetical protein  24.85 
 
 
542 aa  91.3  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.578621  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0251  protein of unknown function DUF342  23.39 
 
 
381 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0226778 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1423  protein of unknown function DUF342  24.16 
 
 
622 aa  88.2  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000579847  normal  0.370296 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0176  protein of unknown function DUF342  24.32 
 
 
660 aa  84  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000513292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1231  hypothetical protein  25.16 
 
 
462 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2021  protein of unknown function DUF342  23.96 
 
 
463 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1534  hypothetical protein  27.92 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.196772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2234  hypothetical protein  26.24 
 
 
484 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.260747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2246  protein of unknown function DUF342  21.52 
 
 
520 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0452  protein of unknown function DUF342  30.36 
 
 
603 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2684  hypothetical protein  29.76 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0881  hypothetical protein  24.07 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1511  hypothetical protein  29.52 
 
 
527 aa  73.9  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0028  protein of unknown function DUF342  24.8 
 
 
525 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3178  hypothetical protein  26.34 
 
 
529 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1534  polymerase  25.37 
 
 
629 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.451593  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0219  protein of unknown function DUF342  20.41 
 
 
501 aa  62.4  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.102298  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1398  hypothetical protein  25.19 
 
 
728 aa  62.4  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1859  hypothetical protein  24.58 
 
 
603 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2410  hypothetical protein  23.48 
 
 
530 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1361  polymerase  22.74 
 
 
653 aa  60.8  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0192  hypothetical protein  26.36 
 
 
455 aa  57.8  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1256  protein of unknown function DUF342  22.08 
 
 
378 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.912515  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0394  hypothetical protein  26.88 
 
 
543 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000249945  normal  0.153411 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0389  protein of unknown function DUF342  27.92 
 
 
578 aa  52  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0194  hypothetical protein  23.97 
 
 
455 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0823  hypothetical protein  25.87 
 
 
691 aa  50.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00604121  normal  0.0176105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>