203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3147t on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3152t  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000938948  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3145t  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3143t  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000544986  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3147t  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000099101  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0761  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000167269  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00011  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000114888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00012  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000124601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0063  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.51209e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0064  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  4.7933e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0735  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000520956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0782  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000722917  normal  0.446267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0033  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4651  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.16576e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0127  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0027737  normal  0.534366 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0783  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000582426  normal  0.4419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5017  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0464  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.99671e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0076  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0736  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000556049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0794  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000236079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0721  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0690  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0689  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0722  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000907062  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0077  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0578  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.87866e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0063  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0160878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5016  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149408  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0032  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666816  hitchhiker  0.000769415 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0033  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706309  hitchhiker  0.000775918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4652  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  9.35384e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0760  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000001352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0830  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000784737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0129  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000954421  normal  0.381097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0795  tRNA-Gln  92.96 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000207498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna139  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna145  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000913211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna137  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna134  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna141  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna150  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01235  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01241  tRNA-Gln  95.08 
 
 		 72 bp  97.6  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0132  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056335  normal  0.277016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0126  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000102885  normal  0.191984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0119  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00174205  normal  0.184991 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0064  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0165002  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0147  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000746626  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0157  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000220492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0045  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000078833  normal  0.0156907 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0032  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0123  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000509299  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0121  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000556083  normal  0.18894 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0154  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000218199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0151  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0149  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000775027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0017  tRNA-Gln  92.59 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000337477  normal  0.142924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0071  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.429355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0072  tRNA-Gln  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  92.31 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.693396  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0012  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.644103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0051  tRNA-Gln  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000244153  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  87.32 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00709266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0046  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.814409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0009  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.001106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2765  tRNA-Gln  93.48 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.114736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0039  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00156517  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00009  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000116069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln01  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGln02  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00912183  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0035  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000486361  normal  0.144926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0038  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000374137  normal  0.148016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0779  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000652384  normal  0.543785 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0780  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.0000640046  normal  0.628389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0826  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000524699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0827  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000850909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0581  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0718  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136719  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0733  tRNA-Gln  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000545743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>