More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3079r on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_r00001  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1542 bp  1814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.01898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00006  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1542 bp  1814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0446208  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00010  16S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 1542 bp  1867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00367496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00011  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1542 bp  1814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0360816  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00014  16S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 1542 bp  1867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0514001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00017  16S ribosomal RNA  90.57 
 
 		 1542 bp  1867    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0241491  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_r00020  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1542 bp  1814    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0003  16S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 1530 bp  1814    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000874227  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0027  16S ribosomal RNA  90.42 
 
 		 1530 bp  1830    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0078  16S ribosomal RNA  90.35 
 
 		 1530 bp  1836    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000571707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0090  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1530 bp  1806    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000103004  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0098  16S ribosomal RNA  90.22 
 
 		 1530 bp  1806    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000143523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0103  16S ribosomal RNA  90.16 
 
 		 1530 bp  1798    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00308735  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0113  16S ribosomal RNA  90.29 
 
 		 1530 bp  1814    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000562425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0043  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1512 bp  1758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0339  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1512 bp  1758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0556  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1512 bp  1758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1609  16S ribosomal RNA  89.97 
 
 		 1512 bp  1766    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.48618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3907  16S ribosomal RNA  89.9 
 
 		 1512 bp  1758    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0001  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1535 bp  1844    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000556781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0007  16S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 1535 bp  1828    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000706702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0015  16S ribosomal RNA  90.52 
 
 		 1535 bp  1855    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120948  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0044  16S ribosomal RNA  90.51 
 
 		 1533 bp  1867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000361532  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0107  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1535 bp  1844    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000137166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0119  16S ribosomal RNA  90.51 
 
 		 1533 bp  1867    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000133633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0122  16S ribosomal RNA  90.65 
 
 		 1535 bp  1871    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0472105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0127  16S ribosomal RNA  90.44 
 
 		 1535 bp  1859    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0001  16S ribosomal RNA  89.73 
 
 		 1535 bp  1748    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000282718  hitchhiker  0.000910883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0007  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1535 bp  1768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150491  normal  0.406366 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0016  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1535 bp  1784    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201681  hitchhiker  0.0000000136741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0071  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1535 bp  1822    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0123  16S ribosomal RNA  90.19 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0163335  normal  0.34966 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0132  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1535 bp  1784    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0261242  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0136  16S ribosomal RNA  89.86 
 
 		 1535 bp  1760    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000885648  hitchhiker  0.000140032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0140  16S ribosomal RNA  90.06 
 
 		 1535 bp  1784    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00248839  normal  0.547637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0143  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1535 bp  1830    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000577207  normal  0.0309772 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0001  16S ribosomal RNA  90.19 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00134291  hitchhiker  0.00347665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0007  16S ribosomal RNA  90.12 
 
 		 1535 bp  1792    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0064778  normal  0.0127919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0016  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1535 bp  1830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00459376  normal  0.131368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0020  16S ribosomal RNA  90.19 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000189863  hitchhiker  0.00241785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0026  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1535 bp  1742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0396739  normal  0.0702195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0071  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1535 bp  1814    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00107251  normal  0.159667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0123  16S ribosomal RNA  90.19 
 
 		 1535 bp  1800    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00322133  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0141  16S ribosomal RNA  90.25 
 
 		 1535 bp  1808    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00125257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0144  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1535 bp  1742    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0816172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0001  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0004  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000248814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0013  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000146432  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0027  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000222685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0030  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000656968  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0061  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000486947  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0121  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000475957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0128  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000157224  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0133  16S ribosomal RNA  89.85 
 
 		 1535 bp  1788    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000510938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0001  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1555 bp  1830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112036  hitchhiker  0.0000014858 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0007  16S ribosomal RNA  90.12 
 
 		 1555 bp  1806    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0012678  normal  0.693673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0016  16S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 1555 bp  1814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251895  hitchhiker  0.00000000270434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0069  16S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 1555 bp  1814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00426901  normal  0.158282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0120  16S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 1555 bp  1814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0520691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0130  16S ribosomal RNA  90.05 
 
 		 1555 bp  1798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0100831  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0136  16S ribosomal RNA  90.18 
 
 		 1555 bp  1814    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000629377  hitchhiker  0.000146985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0140  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1555 bp  1830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0143  16S ribosomal RNA  90.31 
 
 		 1555 bp  1830    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.328707  normal  0.910288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0001  16S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 1539 bp  1756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.144565  normal  0.0385705 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0006  16S ribosomal RNA  89.62 
 
 		 1539 bp  1752    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00603294  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0013  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1539 bp  1750    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0520018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0030  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1539 bp  1750    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000311053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0042  16S ribosomal RNA  89.75 
 
 		 1539 bp  1758    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0730694  normal  0.056387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0058  16S ribosomal RNA  89.61 
 
 		 1539 bp  1756    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0091  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1539 bp  1750    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0107  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1539 bp  1750    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.275652  normal  0.0239597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0110  16S ribosomal RNA  89.68 
 
 		 1539 bp  1750    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0155081  normal  0.0596493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0001  16S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 1537 bp  1818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000407555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0004  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1537 bp  1768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000257645  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0008  16S ribosomal RNA  90.66 
 
 		 1537 bp  1834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000302643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0022  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1537 bp  1770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000152089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0073  16S ribosomal RNA  90.66 
 
 		 1537 bp  1834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0117  16S ribosomal RNA  90 
 
 		 1537 bp  1768    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000829511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0121  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1537 bp  1770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0129  16S ribosomal RNA  90.14 
 
 		 1537 bp  1770    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000475348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0138  16S ribosomal RNA  90.66 
 
 		 1537 bp  1834    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000622632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0142  16S ribosomal RNA  90.53 
 
 		 1537 bp  1818    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000521528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0019  16S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 1545 bp  1741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000981314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0108  16S ribosomal RNA  89.66 
 
 		 1545 bp  1741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0133586  normal  0.0202407 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0001  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1555 bp  1739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000995354  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0005  16S ribosomal RNA  90.02 
 
 		 1555 bp  1760    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000520718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0009  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1555 bp  1739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000407076  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0021  16S ribosomal RNA  89.93 
 
 		 1555 bp  1758    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0068  16S ribosomal RNA  89.8 
 
 		 1555 bp  1742    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000082841  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0115  16S ribosomal RNA  89.81 
 
 		 1555 bp  1739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000362636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0130  16S ribosomal RNA  89.99 
 
 		 1555 bp  1766    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0256321  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0241  16S ribosomal RNA  92.14 
 
 		 1536 bp  2038    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000165146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2076  16S ribosomal RNA  92.27 
 
 		 1535 bp  2054    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000346352  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2332  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1535 bp  2046    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176289  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2338  16S ribosomal RNA  92.14 
 
 		 1535 bp  2038    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000750964  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2460  16S ribosomal RNA  92.14 
 
 		 1535 bp  2038    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000585775  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2540  16S ribosomal RNA  92.2 
 
 		 1536 bp  2046    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000260054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2706  16S ribosomal RNA  92.27 
 
 		 1536 bp  2054    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000399166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2799  16S ribosomal RNA  92.07 
 
 		 1536 bp  2030    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000312291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0001  16S ribosomal RNA  90.26 
 
 		 1537 bp  1800    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000018503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>