More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I3032 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I3032  galactosyl transferase, capsular polysaccharide synthesis enzyme  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2528  sugar transferase  84.07 
 
 		 184 aa  297  5e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  75.69 
 
 		 508 aa  286  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3172  galactosyl transferase  84.62 
 
 		 185 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1485  sugar transferase  85.16 
 
 		 182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00302801  normal  0.381864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0590  putative polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  75.69 
 
 		 188 aa  279  1e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3387  sugar transferase  65.93 
 
 		 182 aa  268  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3271  sugar transferase  65.93 
 
 		 182 aa  266  8e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.11 
 
 		 506 aa  266  1e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2877  sugar transferase  82.97 
 
 		 184 aa  265  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0812  sugar transferase  68.68 
 
 		 185 aa  259  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.201129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2640  putative capsule biosynthesis protein  68.13 
 
 		 184 aa  231  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1277  sugar transferase  60.22 
 
 		 183 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1843  galactosyl-transferase, putative  62.09 
 
 		 191 aa  229  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2612  sugar transferase  69.54 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00297652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1539  sugar transferase  56.59 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0350538  hitchhiker  0.0019273 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0778  sugar transferase  49.41 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0745  sugar transferase  45 
 
 		 451 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5069  sugar transferase  47.53 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4101  sugar transferase  41.53 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0756237 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0152  sugar transferase  48.95 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0147  sugar transferase  48.95 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3507  sugar transferase  42.17 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1586  sugar transferase  38.37 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0491146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2247  capsular polysaccharide synthesis protein  41.86 
 
 		 188 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.436876  hitchhiker  0.00758225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1337  sugar transferase  38.59 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0288404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1626  sugar transferase  47.22 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6496  sugar transferase  45.77 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3388  sugar transferase  45.14 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0569  sugar transferase  40.22 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00336814  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0633  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.48 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.339085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1277  sugar transferase  41.18 
 
 		 186 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0679585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1263  sugar transferase  50.43 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3481  sugar transferase  51.3 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0937708  normal  0.263675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2615  sugar transferase  40.8 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3985  sugar transferase  43.06 
 
 		 186 aa  121  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1493  sugar transferase  43.42 
 
 		 200 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2587  sugar transferase  37.5 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6006  sugar transferase  45.07 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1752  sugar transferase  43.24 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.637714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0384  sugar transferase  41.18 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1698  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  41.18 
 
 		 204 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.965123  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3821  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  38.12 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3127  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  38.89 
 
 		 501 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.526829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3256  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  42.68 
 
 		 207 aa  112  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1927  sugar transferase  40.65 
 
 		 466 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26599  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5393  UDP-galactose phosphate transferase  36.67 
 
 		 230 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3064  sugar transferase  43.92 
 
 		 490 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0763  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.85 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2713  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.28 
 
 		 473 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2163  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  37.08 
 
 		 498 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1597  sugar transferase, PEP-CTERM system associated  37.17 
 
 		 461 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1377  sugar transferase  43.36 
 
 		 329 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.643724  hitchhiker  0.00000754097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0120  sugar transferase  38.83 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5883  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  42.57 
 
 		 482 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179814  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3142  sugar transferase, putative  37.28 
 
 		 473 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0115  sugar transferase  38.83 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2523  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  43.38 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5447  exopolysaccharide production protein ExoY  45.11 
 
 		 134 aa  108  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2572  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.28 
 
 		 473 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2901  sugar transferase  44.06 
 
 		 358 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3218  sugar transferase  40.22 
 
 		 467 aa  107  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4820  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.89 
 
 		 242 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1533  sugar transferase  40.34 
 
 		 365 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2903  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  36.87 
 
 		 472 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4990  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  40.12 
 
 		 491 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1879  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  38.16 
 
 		 314 aa  107  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.439269  hitchhiker  0.0000110821 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3032  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  42.66 
 
 		 346 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1487  sugar transferase  40.14 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4475  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  47.18 
 
 		 463 aa  106  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0584  glycosyltransferase  41.83 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000164965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3033  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase, WbaP  42.21 
 
 		 478 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4356  sugar transferase  38.46 
 
 		 225 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2485  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.13 
 
 		 460 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0918  colanic biosynthesis UDP-glucose lipid carrier transferase  34.13 
 
 		 460 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3537  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  35.12 
 
 		 488 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0569176 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2623  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  34.13 
 
 		 460 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2276  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  40.38 
 
 		 456 aa  105  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000104182  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1068  putative glycosyl transferase  35.33 
 
 		 494 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.676615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0631  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  37.97 
 
 		 234 aa  105  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4237  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  30.77 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.952439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4919  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  33.53 
 
 		 477 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  hitchhiker  0.00190784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1494  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.94 
 
 		 212 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4955  sugar transferase; phospho-glucosyltransferase  40.65 
 
 		 228 aa  104  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000228905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1612  capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.94 
 
 		 212 aa  104  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.631818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3531  Undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  34.29 
 
 		 233 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1680  putative capsular polysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  40.94 
 
 		 212 aa  104  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4532  sugar transferase  41.61 
 
 		 505 aa  104  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1414  sugar transferase  42.76 
 
 		 198 aa  104  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3047  sugar transferase  36.63 
 
 		 243 aa  104  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1034  undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  37.72 
 
 		 490 aa  104  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1466  undecaprenyl-phosphate galactosephosphotransferase  40.94 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0080472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1395  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  40.91 
 
 		 470 aa  103  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275666  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2276  sugar transferase  36.53 
 
 		 457 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.162354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3644  undecaprenyl-phosphate galactose phosphotransferase  36.47 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.212728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4543  sugar transferase  36.84 
 
 		 478 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0466  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.03 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000106234  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2459  exopolysaccharide biosynthesis polyprenyl glycosylphosphotransferase  39.04 
 
 		 498 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.721842  normal  0.253971 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3820  sugar transferase  36.84 
 
 		 478 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0818  Undecaprenyl-phosphate glucose phosphotransferase  36.67 
 
 		 461 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>