More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2981 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 126 aa  246  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  70.97 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  70.97 
 
 		 127 aa  177  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  65.6 
 
 		 126 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  57.02 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  51.61 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 		 124 aa  100  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  50.42 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 127 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 124 aa  94  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  41.59 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  50.42 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.16 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.9 
 
 		 228 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 125 aa  84.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  44.44 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.03 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  43.8 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  41.13 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  47.11 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 125 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.52 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  38.18 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.18 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  36.07 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  36.59 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  36.59 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  39.25 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  46.36 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.14 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  33.86 
 
 		 193 aa  73.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  41.18 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.39 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  36.36 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  38.6 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.67 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  34.17 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  37.76 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  33.33 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  39.6 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  41.76 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  30.36 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  35.04 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  34.48 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  31.93 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.04 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.72 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.48 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.83 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>