More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2899 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  100 
 
 		 107 aa  226  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  67.29 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  67.29 
 
 		 106 aa  157  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  63.21 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  58.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  58.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  60 
 
 		 110 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  60.58 
 
 		 106 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  58.49 
 
 		 108 aa  130  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  57.55 
 
 		 108 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  57.43 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  57.43 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  57.43 
 
 		 109 aa  127  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  58 
 
 		 108 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  59 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  59 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  59 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  59 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  58 
 
 		 108 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  56 
 
 		 106 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  54 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  53.06 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  53.06 
 
 		 100 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  51.02 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  43.69 
 
 		 103 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 110 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  45.54 
 
 		 101 aa  104  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 		 101 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 102 aa  103  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 		 101 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  45 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  48.11 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  44.55 
 
 		 101 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  48.42 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  47.17 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 102 aa  100  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  44.44 
 
 		 106 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  43.43 
 
 		 110 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  41.58 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  41.58 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  44.57 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  40.78 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  41.51 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  52.7 
 
 		 110 aa  94  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  42.45 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  43.56 
 
 		 101 aa  92.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  40.59 
 
 		 102 aa  92.8  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  49.5 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  36.63 
 
 		 272 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  37.76 
 
 		 656 aa  81.6  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  41.18 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  44.59 
 
 		 245 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  36 
 
 		 108 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  35.14 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  35.79 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  37.5 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  36.84 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  32.98 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  31.73 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  32.67 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  35.48 
 
 		 261 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3835  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  33.98 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  31.96 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0137  rhodanese domain-containing protein  32.38 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5422  rhodanese domain-containing protein  35.51 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.500506  normal  0.598915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5042  rhodanese-like protein  34.58 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5130  rhodanese domain-containing protein  34.58 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183608  normal  0.915775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  30.77 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  33.7 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  34.18 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  33.01 
 
 		 141 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  33.98 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  29.81 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  34.12 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  31.37 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  32.04 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  33.33 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  34.44 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1816  hypothetical protein  38.64 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>