234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2665 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  100 
 
 
368 aa  764    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  65.49 
 
 
367 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  63.32 
 
 
367 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  63.51 
 
 
367 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  63.41 
 
 
365 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4344  AFG1 family ATPase  62.7 
 
 
371 aa  469  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.659976  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  63.66 
 
 
368 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3361  AFG1 family ATPase  59.35 
 
 
370 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000732022  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  60.33 
 
 
368 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3295  AFG1 family ATPase  59.62 
 
 
368 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000879421  hitchhiker  0.00125364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  59.35 
 
 
368 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3596  AFG1 family ATPase  57.99 
 
 
367 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000179284  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  57.72 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  57.72 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0505  AFG1-like ATPase  58.54 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000013161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  57.99 
 
 
386 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  58.76 
 
 
369 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  57.45 
 
 
370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0743  AFG1 family ATPase  56.64 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000113229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  57.45 
 
 
370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  57.45 
 
 
370 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0677  AFG1 family ATPase  57.45 
 
 
386 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000859941  hitchhiker  0.00165359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  57.72 
 
 
388 aa  443  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  59.36 
 
 
374 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1312  AFG1-family ATPase  58.97 
 
 
364 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  58.11 
 
 
364 aa  434  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4537  AFG1 family ATPase  58.7 
 
 
364 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4412  AFG1 family ATPase  58.7 
 
 
364 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  55.86 
 
 
377 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4428  ATPase, putative  57.61 
 
 
364 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.807531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  56.52 
 
 
364 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4122  AFG1-like ATPase  57.34 
 
 
364 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4698  AFG1-like ATPase  57.07 
 
 
364 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00399589  normal  0.061499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4350  AFG1 family ATPase  56.3 
 
 
376 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000166753  hitchhiker  0.003638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  55.76 
 
 
375 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  56.52 
 
 
364 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.994085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  55.23 
 
 
375 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  55.41 
 
 
374 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  54.86 
 
 
374 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  55.23 
 
 
375 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  55.14 
 
 
374 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  54.96 
 
 
375 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1135  hypothetical protein  55.14 
 
 
375 aa  408  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114731  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0458  ATPase, AFG1 family protein  55.14 
 
 
375 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000213862  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  54.96 
 
 
375 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  54.96 
 
 
375 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  54.96 
 
 
375 aa  410  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  54.86 
 
 
374 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  54.96 
 
 
375 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  55.28 
 
 
374 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0523  AFG1 family ATPase  55.14 
 
 
375 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000232389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3640  AFG1-family ATPase  56 
 
 
376 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0569436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  55.11 
 
 
376 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3538  ATPase, AFG1 family  54.86 
 
 
374 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  54.69 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0919  AFG1 family ATPase  62.03 
 
 
339 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.961251  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  53.4 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  52.72 
 
 
366 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  54.42 
 
 
383 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0291  AFG1-family ATPase  53.89 
 
 
383 aa  393  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00126781  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  52.97 
 
 
372 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3165  hypothetical protein  52.57 
 
 
393 aa  387  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.885121  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2878  AFG1 family ATPase  52.85 
 
 
372 aa  382  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.067299  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  49.04 
 
 
372 aa  363  3e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  49.45 
 
 
360 aa  358  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  47.27 
 
 
373 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.432883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1288  AFG1-like ATPase protein  46.99 
 
 
373 aa  342  5e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  48.2 
 
 
360 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  45.18 
 
 
371 aa  325  1e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03824  ATPase  43.24 
 
 
361 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  42.35 
 
 
366 aa  311  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  45.88 
 
 
371 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0407  ATPase  45.05 
 
 
392 aa  309  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1767  AFG1 family ATPase  44.82 
 
 
365 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  44.93 
 
 
365 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2047  AFG1-like ATPase  45.48 
 
 
365 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0831727  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2044  AFG1-like ATPase  44.66 
 
 
365 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136156  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  45.75 
 
 
365 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1643  AFG1-family ATPase  45.3 
 
 
365 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.0874799 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1541  AFG1 family ATPase  47.87 
 
 
341 aa  301  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.314892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2809  putative ATPase, AFG1-like  45.03 
 
 
365 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.735018  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1718  AFG1 family ATPase  44.75 
 
 
365 aa  298  9e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1744  AFG1 family ATPase  44.2 
 
 
365 aa  297  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  44.6 
 
 
367 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1049  ATPase, AFG1 type  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1927  ATPase, AFG1 type  43.65 
 
 
365 aa  297  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.74358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2553  ATPase, AFG1 type  43.92 
 
 
365 aa  296  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1003  ATPase, AFG1 type  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.064269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1495  ATPase, AFG1 type  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0163  ATPase, AFG1 type  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1753  AFG1 family ATPase  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1775  AFG1 family ATPase  43.65 
 
 
366 aa  296  3e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420148  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  45.43 
 
 
366 aa  295  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1031  AFG1-like ATPase  43.92 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1511  AFG1 family ATPase  43.92 
 
 
365 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  45.15 
 
 
367 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2621  AFG1-like ATPase  45.13 
 
 
367 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338976  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  45.08 
 
 
367 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  45.15 
 
 
367 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4652  AFG1-like ATPase  43.37 
 
 
383 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.49278  normal  0.23421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>