More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2575 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  100 
 
 		 1127 aa  2311    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  63.48 
 
 		 1177 aa  1461    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  63.71 
 
 		 1111 aa  1451    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  63.9 
 
 		 1128 aa  1450    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 		 1096 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  41.37 
 
 		 1119 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  39.27 
 
 		 1207 aa  363  7.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  40.31 
 
 		 1130 aa  362  3e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  39.47 
 
 		 1133 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 1526 aa  345  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  41.65 
 
 		 1016 aa  306  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  39.22 
 
 		 1018 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.11 
 
 		 687 aa  247  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  33.62 
 
 		 968 aa  246  1.9999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 1274 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 		 1977 aa  241  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  36.21 
 
 		 1022 aa  239  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1117  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 		 770 aa  238  7e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0185  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1214 aa  229  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467777  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1127 aa  227  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2948  histidine kinase  31.15 
 
 		 800 aa  226  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 		 858 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 		 817 aa  223  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  32.2 
 
 		 631 aa  222  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 		 977 aa  222  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  33.61 
 
 		 1392 aa  221  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.32 
 
 		 667 aa  218  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  31.33 
 
 		 810 aa  218  5.9999999999999996e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1433 aa  218  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.28 
 
 		 1109 aa  217  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  34.94 
 
 		 548 aa  216  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.42 
 
 		 1152 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 		 785 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  33.75 
 
 		 606 aa  215  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5091  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 1479 aa  214  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.493325  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 1711 aa  214  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 631 aa  214  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.89 
 
 		 1691 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.21 
 
 		 1514 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1223 aa  213  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.21 
 
 		 1514 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2180  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 		 922 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.238731  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  31.83 
 
 		 578 aa  211  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 		 1452 aa  211  8e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3009  histidine kinase  32.33 
 
 		 603 aa  211  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 823 aa  210  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 		 995 aa  210  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  32.84 
 
 		 919 aa  209  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  34.26 
 
 		 571 aa  209  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 1078 aa  209  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  34.45 
 
 		 1060 aa  209  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1853 aa  209  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 989 aa  208  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 		 1431 aa  208  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.74 
 
 		 853 aa  208  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 606 aa  208  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  29.34 
 
 		 528 aa  207  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  33.17 
 
 		 559 aa  207  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 765 aa  207  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 969 aa  207  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3445  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 717 aa  207  9e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 721 aa  207  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  33.67 
 
 		 758 aa  207  9e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  28.75 
 
 		 910 aa  207  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 		 969 aa  206  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  28.23 
 
 		 742 aa  207  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  33.58 
 
 		 797 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2202  histidine kinase  31.06 
 
 		 613 aa  206  1e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.143763  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.37 
 
 		 1323 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  33.42 
 
 		 882 aa  206  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  32.66 
 
 		 556 aa  206  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 1406 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  30.06 
 
 		 651 aa  205  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1383 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 989 aa  205  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  27.03 
 
 		 810 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3492  Cache sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 1041 aa  205  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 		 781 aa  204  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 		 631 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4253  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.87 
 
 		 1843 aa  205  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  33.04 
 
 		 945 aa  204  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 902 aa  204  7e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 1362 aa  204  8e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.95 
 
 		 1039 aa  204  9e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0381  sensory box histidine kinase/response regulator  29.8 
 
 		 497 aa  203  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 844 aa  203  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1121 aa  203  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0286  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 		 1406 aa  203  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 		 1044 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 1118 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4276  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1847 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  28.75 
 
 		 998 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 1131 aa  203  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  32.47 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 1611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.42 
 
 		 1099 aa  203  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  33.12 
 
 		 802 aa  202  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 1153 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 791 aa  202  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108732  normal  0.835393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>