185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2566 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2566  adenosylcobinamide-phosphate synthase  100 
 
 		 317 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000687479  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00922  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.6 
 
 		 331 aa  341  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004472  adenosylcobinamide-phosphate synthase  51.1 
 
 		 317 aa  332  5e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1958  adenosylcobinamide-phosphate synthase  52.37 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2967  CobD-related protein  28.2 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33100  cobalamin biosynthesis protein  25.91 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00042631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1114  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.27 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1644  cobalamin biosynthesis protein  26.09 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.29794  normal  0.0167016 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1000  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.12 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3678  cobalamin biosynthesis protein  26.88 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.035544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1753  cobalamin biosynthesis protein  25.53 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1711  cobalamin biosynthesis protein CobD  26.48 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01626  adenosylcobinamide-phosphate synthase  28.52 
 
 		 314 aa  95.5  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0854  CobD-related protein  25.8 
 
 		 329 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.411862 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1234  cobalamin biosynthesis protein  27.31 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.778235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4044  cobalamin biosynthesis protein  25.27 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1675  cobalamin biosynthesis protein  25.27 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1274  cobalamin biosynthesis protein  26.38 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3494  cobalamin biosynthesis protein  26.56 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1458  cobalamin biosynthesis protein CobD  25 
 
 		 300 aa  92.4  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.862014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0517  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.74 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0140  cobalamin biosynthesis protein  26.55 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1003  cobalamin biosynthesis protein  24.81 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1216  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.09 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2205  cobalamin biosynthesis protein  23.83 
 
 		 313 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0351195  normal  0.625062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2716  cobalamin biosynthesis protein  23.86 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.530545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47730  cobalamin biosynthesis protein  25.67 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.452767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4115  cobalamin biosynthesis protein  25.19 
 
 		 312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1133  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.35 
 
 		 329 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.339799  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0271  cobalamin biosynthesis protein  24.39 
 
 		 319 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1252  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.08 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.196954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3138  cobalamin biosynthesis protein CbiB  27.08 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.645518 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1321  CobD-related protein  26.09 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1219  cobalamin biosynthesis protein CbiB  26.35 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.51829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1837  cobalamin biosynthesis protein  25.19 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2957  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.63 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.948861  normal  0.0341254 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2448  cobalamin biosynthesis protein  25.19 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3053  cobalamin biosynthesis protein CbiB  25.36 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0327642 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2453  cobalamin biosynthesis protein  25.19 
 
 		 312 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.393352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3677  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.6 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.544295 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2875  cobalamin biosynthesis protein CbiB  24.83 
 
 		 330 aa  79  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0980593  hitchhiker  0.000833797 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0102  cobalamin biosynthesis protein  24.54 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1026  cobalamin biosynthesis protein CbiB  23.18 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.188551  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2089  cobD; cobalamin biosynthetic protein  25.71 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2496  cobalamin biosynthesis protein  27.85 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315833  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2364  cobalamin biosynthesis protein  27.85 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2287  cobalamin biosynthesis protein  22.35 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.731902  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2200  cobalamin biosynthesis protein  22.41 
 
 		 326 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0660969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1131  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.79 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5779  cobalamin biosynthesis protein  25 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2818  adenosylcobinamide-phosphate synthase  27.14 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00349182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0846  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1044  CobD/CbiB family protein  20.69 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.211721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2802  CobD-related protein  28.78 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.294176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4742  cobD/cbiB family protein  23.97 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0695  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1198  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2318  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0401808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2969  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1037  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1043  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1630  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.187303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1143  putative cobalamin biosynthesis protein D  21.54 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1857  cobalamin biosynthesis protein CobD  24.09 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0419  cobalamin biosynthesis protein  22.87 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1682  cobalamin biosynthesis protein CobD  25.56 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1011  CobD/CbiB family protein  23.22 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322198  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2780  cobalamin biosynthesis protein  23.38 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0845124  normal  0.636847 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2658  cobalamin biosynthesis protein  24.32 
 
 		 326 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.869405 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1233  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.56 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2578  CobD/CbiB family protein  24.66 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1424  adenosylcobinamide-phosphate synthase  20.77 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3731  cobalamin biosynthesis protein  26.75 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2392  cobalamin biosynthesis protein  22.88 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0151839 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1033  CobD/CbiB family protein  23.33 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0595  CobD/CbiB family protein  23.33 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1074  CobD/CbiB family protein  23.33 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2229  CobD/CbiB family protein  23.44 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0842  cobalamin biosynthesis protein  29.05 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.98695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0774  CobD/CbiB family protein  23.7 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.219768 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0954  CobD/CbiB family protein  22.97 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.164316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0950  CobD/CbiB family protein  22.97 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4188  CobD/CbiB family protein  22.97 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5371  cobalamin biosynthesis protein CobD  23.53 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0663  cobalamin biosynthesis protein  23.9 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2972  CobD/CbiB family protein  24.02 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.402163  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1294  cobalamin biosynthesis protein  21.63 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7401  adenosylcobinamide-phosphate synthase  23.4 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2209  cobalamin biosynthesis protein  18.97 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0396  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0206694  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2539  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.207097  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0912  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2852  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0235  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1666  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.805294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2962  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2912  CobD/CbiB family protein  21.05 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3023  CobD/CbiB family protein  25 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.473012  normal  0.958188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1113  cobalamin biosynthesis protein  21.63 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.386524  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1721  adenosylcobinamide-phosphate synthase  22.02 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>