More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2480 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2480  integrase, phage family  100 
 
 		 413 aa  856    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00704938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1601  phage integrase family protein  70.94 
 
 		 416 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.634793  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004301  phage integrase  71.67 
 
 		 415 aa  624  1e-177  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  69.49 
 
 		 414 aa  614  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  71.15 
 
 		 422 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4740  integrase family protein  68.8 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0747  Phage integrase  69.7 
 
 		 418 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236649  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  68.29 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  66.18 
 
 		 418 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1267  phage integrase family protein  63.88 
 
 		 409 aa  550  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0699075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1471  phage integrase family site specific recombinase  63.04 
 
 		 415 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  61.42 
 
 		 408 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2743  phage integrase  60.58 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0469991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2855  phage integrase family protein  60.7 
 
 		 412 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.866183 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  55.08 
 
 		 398 aa  461  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1281  integrase family protein  56.35 
 
 		 410 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.250481  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  55.22 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  53.81 
 
 		 415 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01122  integrase  52.72 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  53.51 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  50.36 
 
 		 413 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  53.33 
 
 		 411 aa  441  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  53.69 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  52.97 
 
 		 409 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1686  phage integrase family protein  54.32 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.034435  normal  0.0441759 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1761  phage integrase family protein  54.07 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0148676  normal  0.285781 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1791  phage integrase family protein  54.32 
 
 		 411 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.275952  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  50.97 
 
 		 416 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  53.03 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  50.98 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  51.4 
 
 		 403 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  50.36 
 
 		 413 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  49.88 
 
 		 402 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  50.62 
 
 		 416 aa  425  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1370  prophage CP4-57 integrase  49.36 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000288538  normal  0.0147519 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  48.78 
 
 		 416 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  53.1 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  47.62 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  47.62 
 
 		 409 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  47.62 
 
 		 436 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  44.74 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  45 
 
 		 423 aa  348  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  42.96 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003253  phage integrase  39.17 
 
 		 448 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  40.72 
 
 		 404 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  39.9 
 
 		 391 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  34.92 
 
 		 404 aa  282  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  36.6 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  37.22 
 
 		 401 aa  272  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  37.15 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.02 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  37.86 
 
 		 387 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  37.08 
 
 		 396 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  37.34 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  35.9 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  36.79 
 
 		 397 aa  266  5e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  35.9 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.18 
 
 		 394 aa  266  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  34.09 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  33.83 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.92 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  33.83 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  35.75 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  38.12 
 
 		 409 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  37.75 
 
 		 438 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  36.43 
 
 		 394 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  37.15 
 
 		 396 aa  262  6.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  36.41 
 
 		 396 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  35.04 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  33.84 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02085  prophage CP4-like integrase  36.36 
 
 		 412 aa  256  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00159504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  34.7 
 
 		 395 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  32.99 
 
 		 404 aa  256  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  38.12 
 
 		 387 aa  255  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  35.5 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  32.82 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  35.86 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  35.86 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  32.75 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  36.11 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01627  integrase  43.37 
 
 		 290 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  33.83 
 
 		 421 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  35.35 
 
 		 404 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  36.73 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  35.25 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  37.63 
 
 		 427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  36.36 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1358  integrase, truncation  83.46 
 
 		 158 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.760246  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  36.16 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  33.01 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  35.52 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  35.59 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  34.07 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  33.99 
 
 		 419 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  35.04 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  34.78 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  35.35 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4814  site-specific recombinase, phage integrase family protein  34.73 
 
 		 422 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.751833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  34.76 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>