More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2475 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  100 
 
 		 565 aa  1167    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  72.79 
 
 		 554 aa  814    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  72.43 
 
 		 554 aa  812    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  68.65 
 
 		 554 aa  768    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  55.62 
 
 		 554 aa  622  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  54.97 
 
 		 553 aa  617  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  55.43 
 
 		 552 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3296  recombination and repair protein  54.53 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182341  decreased coverage  0.000158665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  55.07 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3151  recombination and repair protein  54.53 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0961248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3153  recombination and repair protein  54.53 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000145597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1196  recombination and repair protein  55.78 
 
 		 553 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  54.71 
 
 		 552 aa  610  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  55.25 
 
 		 552 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  55.43 
 
 		 552 aa  611  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1218  recombination and repair protein  54.53 
 
 		 552 aa  608  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.187963  normal  0.0934404 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  54.33 
 
 		 553 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  53.99 
 
 		 552 aa  599  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1151  recombination and repair protein  55.68 
 
 		 554 aa  595  1e-169  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.901201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0914  DNA repair protein RecN  53.32 
 
 		 558 aa  594  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.473015  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  53.61 
 
 		 553 aa  588  1e-166  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  53.43 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  53.43 
 
 		 553 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  53.25 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  53.25 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  52.89 
 
 		 553 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  53.25 
 
 		 553 aa  581  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  53.25 
 
 		 553 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  53.07 
 
 		 553 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  53.07 
 
 		 553 aa  574  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  50.62 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  50.62 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  50.62 
 
 		 553 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  50.72 
 
 		 553 aa  546  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  51.26 
 
 		 553 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  48.73 
 
 		 557 aa  546  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0963  recombination and repair protein  49.82 
 
 		 553 aa  543  1e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0199907  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0728  recombination and repair protein  50.18 
 
 		 553 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.118324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  49.64 
 
 		 561 aa  527  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3825  DNA repair protein RecN  48.12 
 
 		 561 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321139  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0651  DNA repair protein  48.47 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 559 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  46.49 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  46.77 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  43.06 
 
 		 567 aa  477  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  45.77 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  46.42 
 
 		 558 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  45.23 
 
 		 557 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  45.23 
 
 		 557 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  43.66 
 
 		 608 aa  469  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  43.66 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  45.83 
 
 		 557 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  45.65 
 
 		 557 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  45.23 
 
 		 557 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  45.47 
 
 		 557 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  45.29 
 
 		 557 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  41.12 
 
 		 559 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  41.62 
 
 		 564 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.01 
 
 		 557 aa  428  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  41.37 
 
 		 557 aa  428  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  42.29 
 
 		 555 aa  422  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1860  DNA repair protein RecN  40.39 
 
 		 558 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.457848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  42.22 
 
 		 555 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  42.75 
 
 		 555 aa  419  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  42.78 
 
 		 556 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  41.65 
 
 		 553 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  40.33 
 
 		 556 aa  411  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2214  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.725261  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2333  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3329  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1107  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0249547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0492  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3319  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3286  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0539815  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0932  DNA repair protein RecN  39.03 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  41.71 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1300  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 549 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00383913  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  39.96 
 
 		 553 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1726  DNA repair protein RecN  39.93 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.995264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2641  DNA repair protein RecN  40.11 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  39.75 
 
 		 591 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 549 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  39.28 
 
 		 549 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.13 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1301  DNA repair protein RecN  39.21 
 
 		 547 aa  376  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4337  DNA repair protein RecN  39.15 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0513473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.78 
 
 		 568 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>