More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2409 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  100 
 
 		 103 aa  206  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  63.46 
 
 		 104 aa  135  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  62.5 
 
 		 104 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  62.75 
 
 		 107 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  59.05 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  48.54 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  48.54 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  48.54 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  53.4 
 
 		 98 aa  106  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  54.44 
 
 		 108 aa  99  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  55.34 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  55.56 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  47.42 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  42.57 
 
 		 146 aa  88.2  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 206 aa  87.4  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  51.85 
 
 		 98 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  41.51 
 
 		 206 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  43.93 
 
 		 207 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  48.39 
 
 		 113 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  43.4 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  51.9 
 
 		 108 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  44.12 
 
 		 318 aa  83.6  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  44.68 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  50.49 
 
 		 101 aa  82.8  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  40.57 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0954  hypothetical protein  40 
 
 		 110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  43.88 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  38.89 
 
 		 207 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  43.27 
 
 		 229 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  42.11 
 
 		 105 aa  78.2  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  38.68 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  38.68 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  44.44 
 
 		 205 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  44.44 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  43.27 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.85 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  42.57 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  42.68 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  37.38 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  41.9 
 
 		 200 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3093  cytochrome c class I  43.37 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  46.91 
 
 		 102 aa  72  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  44.66 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  44.05 
 
 		 206 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  40.95 
 
 		 200 aa  70.9  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  33.96 
 
 		 207 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0313  cytochrome c552  45.21 
 
 		 100 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.577665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  42.5 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  34.34 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  39 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0287  cytochrome c, class I  38.89 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.745608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  44.29 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  34.34 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0261  cytochrome C, c4  38.89 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  42.11 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  43.3 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  35.35 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  42.86 
 
 		 198 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3403  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 266 aa  67  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.670594  normal  0.50409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3050  cytochrome c, class I  42.71 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000221964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  38.55 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  42.11 
 
 		 195 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1889  cytochrome c, class I  41.46 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  37.38 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  40.38 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  37.8 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1024  cytochrome c, class I  37.39 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462828  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  39.53 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  34.38 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  43.75 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  38.68 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 211 aa  64.3  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  42.47 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  39.29 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.29 
 
 		 191 aa  63.9  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  45.12 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  36.73 
 
 		 206 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1848  cytochrome c class I  43.9 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.298737  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  40 
 
 		 238 aa  63.5  0.0000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  44.93 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  37.96 
 
 		 111 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  47.19 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  35.16 
 
 		 107 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  37.62 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2865  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  43.28 
 
 		 226 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>